动物细胞染色体DNA之制备详细的方法步骤!
阅读:2260 发布时间:2012-10-18
动物细胞染色体DNA之制备
I.目的
动物、植物及微生物等的基因图谱(gene mapping)的构筑,以及基因顺序(gene sequencing)的建立与分析比较,是目前分子生物研发的重要课题。本实验设计乃针对动物细胞培养之后,抽取染色体DNA为*步,后续的DNA定序、基因分析、图谱建立、DNA鑑定等于渊展开。
以目前的估计,人类约有10万个基因,30亿个碱基。预定在2005年将人类基因*解析出来,并确定它们在染色体上的位置。根据1990年当时的物价,每解析出一个碱基的平均成本约为美金1元,故HGP总共需约30亿美金来完成。
一旦人类基因舆图*解析出来之后,科学家就可以寻找每段基因的功能,利用这些资料进一步找出疾?。ㄈ鏰i症或心脏?。┯牖虻墓叵担硗庖嗵峁┛⑿乱┗蜓罢倚轮瘟品椒ǖ牧煊?,如同在美国NASDAQ上的网路股一样,充满了无限的想像空间。在巨大商业利益的引诱之下,许多私人制药公司已经开始投入HGP的研究工作,期能将重要的基因找出来
II.染色体DNA的制备
1.仪器用具:
a. 无菌操作台
b. 37 ℃细胞培养箱
c. 倒立显微镜
d. 50 ℃恒温箱具摇盪器
e. 冷冻离心机
2.药品及试剂:
a. 同实验20
b. Digestion buffer (100 mM NaCl, 10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 25 mM EDTA, 0.5% SDS, fresh 0.1 mg/ml proteinase K)
c. phenol/chloroform
3.方法步骤:
1)培养HeLa细胞在100 mm培养皿中3~4天,让细胞佔满生长平面空间(confluence < 3 ´ 107 cells ),加入10 ml PBS缓衝液清洗细胞表面,再将PBS儘量*吸掉。
2)加入1 ml Trypsin-EDTA(以能覆盖细胞表面为原则),置入37 °C细胞培养箱数分钟,单层细胞全脱落。
3)加入3 ml培养液冲洗下细胞,在4 °C下以4,000 rpm离心1分钟。
4)吸掉上层液,加入5 ml PBS悬浮细胞,在4 °C下以4,000 rpm离心1分钟。
5)吸掉上层液,加入30 ml digestion buffer悬浮细胞转移到1.5 ml微量离心管中,置于摇盪器上放入50 °C恒温箱中过夜*。
6)取出微量离心管,小心加入300 ml phenol 萃取(参照实验2)。
7)离心后转移上清液至新的微量离心管,加水成总体积为500 ml,加入phenol/chloroform做萃取(参照实验2)。
8)离心后,做酒精沈淀DNA(参照实验2)。
9)将染色体DNA悬浮于300 ml TE溶液中,取少量作DNA定量分析(参照实验2)。
10)取染色体DNA用EcoRI做限制酶切割,并做DNA电泳分析(参照实验3)。
*注:1.在步骤5之后,若DNA黏滞性太高,无法做萃取时,建议在过夜反应后,以1ml针筒剧烈抽放染色体DNA,以抽放重覆动作,可把DNA作物理性截断(shearing),或利用超音波破膜机来截断DNA。
2.染色体DNA若有截断处理,到步骤10即可省略限制酶EcoRI的切割,直接作电泳分析。
参考资料:
显微镜百科
http://www.jiance17.com