當前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測技術服務>>蛋白分析>> 如何通過質譜實現(xiàn)糖肽結構的完整分析?
價格 | 詢價 |
---|
糖肽(glycopeptides)作為連接糖鏈與肽鏈的復合分子,廣泛存在于細胞膜蛋白、分泌蛋白和免疫相關蛋白中,對維持蛋白穩(wěn)定性、調控信號通路及介導免疫識別具有重要作用。其復雜的結構構成對分析技術提出了jígāo要求。質譜,憑借其高靈敏、高分辨與分子級別解析能力,已成為糖肽結構研究的核心平臺。本文將梳理實現(xiàn)糖肽完整結構解析的關鍵策略,包括位點定位、糖鏈解析與異構體區(qū)分,幫助科研人員提升糖肽研究效率與數(shù)據(jù)質量。
一、糖肽結構分析的核心難點
糖肽結構信息豐富但異常復雜,主要體現(xiàn)在以下三方面:
1、糖鏈異質性
一個糖基化位點可能連接多種糖鏈結構,涵蓋不同的核心結構、延伸模式和末端修飾,導致信號高度多樣。
2、位點分布不確定
N-糖基化主要發(fā)生在N-X-S/T結構中,而O-糖基化缺乏一致的序列特征,需借助質譜高精度碎裂實現(xiàn)定位。
3、異構體結構識別困難
同分異構糖鏈分子量一致,僅靠質量信息無法區(qū)分其空間構型和鍵連方式,需多維分離和特定碎裂策略支持。
二、富集策略:提升低豐度糖肽信號
在復雜生物樣本中,糖肽含量遠低于非修飾肽,因此必須進行選擇性富集以降低背景干擾并提升檢出能力。
※ 富集技術概覽:
凝集素親和層析:利用糖鏈與凝集素的特異性結合富集特定結構糖肽;
HILIC(親水作用色譜):根據(jù)糖肽較強親水性進行有效分離與保留;
金屬氧化物顆粒(如TiO?):可同時富集糖基化與磷酸化修飾肽段,適用于多修飾聯(lián)用分析。
三、分離策略:解析異構結構的前提
高分辨率分離是區(qū)分糖肽異構體的基礎,可顯著降低共洗脫干擾,提升結構解析精度。
※ 關鍵分離方式:
反相高效液相色譜(RP-HPLC):按肽段疏水性分離,有助于解析肽段序列信息;
HILIC分離:強化糖鏈結構差異的解析,尤其適合同位點多糖型糖肽分析;
多維分離(2D-LC):串聯(lián)HILIC和RP,可實現(xiàn)糖鏈與肽段在兩個維度上的有效解耦。
通過合理的分離策略,可極大提升糖肽檢測的分辨力與動態(tài)范圍,增強質譜圖譜的結構解析能力。
四、碎裂模式:結構信息獲取的核心
糖肽質譜碎裂模式直接影響結構信息的完整性與可解析性,需根據(jù)分析目的選擇合適策略,或進行多模式聯(lián)用。
※ 常用碎裂技術解析:
CID(碰撞誘導解離):優(yōu)先裂解糖鏈,利于糖結構解析,但易丟失位點信息;
HCD(高能碰撞解離):兼顧糖鏈與肽段碎片,提供b/y離子,有助于綜合分析;
ETD/EThcD(電子轉移解離):保留糖鏈完整結構,適合jīngquè定位糖基化位點;
UVPD/UVMPD等新興技術:結合高能光源實現(xiàn)特異性裂解,增強異構體結構差異識別能力。
五、數(shù)據(jù)分析:從譜圖到結構的推斷邏輯
糖肽的質譜數(shù)據(jù)解析需依賴特定算法與數(shù)據(jù)庫支持,并輔以人工審核以確保結構解析的準確性。
※ 關鍵步驟包括:
搜索引擎匹配:利用Byonic、pGlyco等專用算法識別糖基化肽段;
糖鏈數(shù)據(jù)庫對照:與已知糖鏈結構庫(如GlyTouCan)比對推斷糖鏈組成與連接方式;
異構體結構識別:結合保留時間、離子強度與多碎片離子圖譜進行人工驗證;
定量分析與統(tǒng)計學處理:實現(xiàn)不同條件下糖肽表達變化的比較與功能注釋。
六、結構解析工作流程:標準化助力高通量研究
實現(xiàn)糖肽結構的完整解析,需要多個環(huán)節(jié)協(xié)同運作,構建標準化流程:
1、樣本預處理與糖肽富集
2、多維分離增強分辨率
3、多模質譜碎裂獲取全譜結構信息
4、數(shù)據(jù)庫與AI輔助結構推斷
5、人工確認與生物學意義賦值
該流程已在多種研究場景中驗證有效,包括疾病標志物篩選、免疫組化機制研究與糖基化抗體質量控制等。
糖肽作為dànbáizhì翻譯后修飾的重要組成,承載著豐富的生物學功能信息。通過優(yōu)化富集、分離、碎裂與數(shù)據(jù)解析流程,現(xiàn)代質譜技術可實現(xiàn)糖肽結構的高精度、系統(tǒng)化解析,揭示其在生理和疾病中的真實角色。作為zhuānyè的dànbáizhì組與糖基化分析服務機構,百泰派克生物科技構建了覆蓋從樣品制備、分離檢測到結構解析的完整糖肽質譜平臺。平臺配置高分辨質譜系統(tǒng)與多模碎裂能力,支持N-糖、O-糖及多重修飾糖肽的高通量解析,廣泛應用于基礎研究、臨床轉化與生物制藥開發(fā)。如需獲取糖肽質譜方案或定制服務,歡迎聯(lián)系我們!
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優(yōu)勢:
1.采用目前世界上*的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優(yōu)勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統(tǒng)準確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統(tǒng)進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數(shù)據(jù)轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優(yōu)勢:
1.技術*,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數(shù)量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質生物藥物分析服務,幫助生物醫(yī)藥生產商提高生物藥物品質。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質量研究服務;
3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優(yōu)質的生物質譜分析服務!
請輸入賬號
請輸入密碼
請輸驗證碼
以上信息由企業(yè)自行提供,信息內容的真實性、準確性和合法性由相關企業(yè)負責,化工儀器網(wǎng)對此不承擔任何保證責任。
溫馨提示:為規(guī)避購買風險,建議您在購買產品前務必確認供應商資質及產品質量。