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北京百泰派克生物科技有限公司
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PMF vs MS/MS:多肽測(cè)序技術(shù)原

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PMF vs MS/MS:多肽測(cè)序技術(shù)原理與應(yīng)用解析檢測(cè)技術(shù)服務(wù): 多肽測(cè)序技術(shù)多肽測(cè)序技術(shù)通過(guò)確定dànbáizhì氨基酸序列及翻譯后修飾,科研人員能夠深入解析生命過(guò)程,發(fā)現(xiàn)新的疾病標(biāo)志物,推進(jìn)藥物靶點(diǎn)開(kāi)發(fā)。PMF vs MS/MS的多肽測(cè)序技術(shù)原理與應(yīng)用解析將助力科研人員在復(fù)雜樣品和jīngzhǔn研究中選擇zuì合適的策略。目前,隨著質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展,肽段分析的分辨率、靈敏度和通量不斷提升,肽

PMF vs MS/MS:多肽測(cè)序技術(shù)原理與應(yīng)用解析檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

多肽測(cè)序技術(shù)多肽測(cè)序技術(shù)通過(guò)確定dànbáizhì氨基酸序列及翻譯后修飾,科研人員能夠深入解析生命過(guò)程,發(fā)現(xiàn)新的疾病標(biāo)志物,推進(jìn)藥物靶點(diǎn)開(kāi)發(fā)。PMF vs MS/MS的多肽測(cè)序技術(shù)原理與應(yīng)用解析將助力科研人員在復(fù)雜樣品和jīngzhǔn研究中選擇zuì合適的策略。目前,隨著質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展,肽段分析的分辨率、靈敏度和通量不斷提升,肽指紋圖譜(Peptide Mass Fingerprinting, PMF)和串聯(lián)質(zhì)譜(Tandem MS, MS/MS)是當(dāng)前zuì常用的多肽測(cè)序策略,科研人員應(yīng)根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)、樣品特性和研究需求選擇合適策略,或采用多技術(shù)整合,實(shí)現(xiàn)更高分辨率、更高通量的蛋白zhìzǔxué研究。


一、PMF與MS/MS技術(shù)原理概述

1、 Peptide Mass Fingerprinting(PMF):基于肽段質(zhì)量的模式識(shí)別

PMF是質(zhì)譜多肽鑒定的經(jīng)典方法,主要依賴于dànbáizhì酶解后所得多肽的分子質(zhì)量指紋。具體流程包括:

(1) 酶解:將目標(biāo)蛋白用yídànbáiméi等特異性酶切割,生成多肽混合物

(2)質(zhì)譜分析:采用MALDI-TOF(基質(zhì)輔助激光解吸/電離-飛行時(shí)間)測(cè)定多肽分子質(zhì)量(m/z)

(3)數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì):將實(shí)驗(yàn)中獲得的質(zhì)量指紋與理論數(shù)據(jù)庫(kù)中的酶解肽質(zhì)量進(jìn)行匹配,確定蛋白種類。


  • 優(yōu)點(diǎn):操作簡(jiǎn)便、通量高、成本低,適用于單蛋白樣品的快速鑒定。

  • 局限:無(wú)法提供序列信息,低豐度蛋白和復(fù)雜樣本中的多肽鑒定能力有限;翻譯后修飾(PTMs)無(wú)法直接識(shí)別。


2、Tandem Mass Spectrometry(MS/MS):基于肽段碎片離子的序列解析

MS/MS采用串聯(lián)質(zhì)譜進(jìn)行多肽測(cè)序。其核心流程包括:

(1)酶解與分離:同樣*行酶切,通常采用LC(液相色譜)分離肽段

(2)質(zhì)譜檢測(cè):在ESI(電噴霧電離)或MALDI源中,質(zhì)譜儀測(cè)定母離子(前體肽段)的m/z

(3)選擇母離子并解離:選定特定母離子后,在碰撞室中誘導(dǎo)其裂解,產(chǎn)生b、y等系列離子。

(4)檢測(cè)碎片離子:分析碎片離子的質(zhì)量與豐度,推導(dǎo)氨基酸序列,進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)搜索或de novo測(cè)序。


  • 優(yōu)點(diǎn):分辨率高、序列信息完整,可識(shí)別復(fù)雜混合物中低豐度蛋白,能夠定位修飾位點(diǎn)。

  • 局限:對(duì)儀器要求高,操作復(fù)雜,數(shù)據(jù)分析耗時(shí)長(zhǎng)。


二、技術(shù)對(duì)比分析:PMF vs MS/MS


PMF vs MS/MS:多肽測(cè)序技術(shù)原


從技術(shù)本質(zhì)來(lái)看,PMF適合于快速篩選和單蛋白樣品,而MS/MS則適合復(fù)雜樣品解析、修飾鑒定及新蛋白測(cè)序??蒲腥藛T可根據(jù)樣品類型、研究目的和設(shè)備條件,選擇合適策略。


三、應(yīng)用場(chǎng)景與技術(shù)進(jìn)展

1、 PMF的典型應(yīng)用

(1)蛋白純化后的快速鑒定:純化蛋白(如SDS-PAGE膠條回收)經(jīng)yídànbáiméi酶解后,利用MALDI-TOF-PMF匹配數(shù)據(jù)庫(kù),快速確認(rèn)蛋白種類。

(2) dànbáizhì質(zhì)量控制與批次驗(yàn)證:在生物制藥中,常用于批次一致性檢測(cè),保證產(chǎn)品質(zhì)量。

(3) 成本控制與高通量篩選:PMF因通量高、速度快,適合用于大量樣品初篩。


2、MS/MS的典型應(yīng)用

(1)蛋白zhìzǔxué研究:結(jié)合LC-MS/MS,可在復(fù)雜生物樣品(如血漿、組織)中,定性定量分析上千種蛋白;

(2)翻譯后修飾解析:定位磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化等關(guān)鍵修飾位點(diǎn),揭示功能調(diào)控機(jī)制;

(3)新抗原和生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn):肽測(cè)序在腫瘤miǎnyìzhìliáo、新藥研發(fā)中用于發(fā)現(xiàn)新抗原或疾病相關(guān)肽段;

(4)de novo測(cè)序與物種特異蛋白解析:無(wú)需數(shù)據(jù)庫(kù),直接解析未知蛋白序列。


四、未來(lái)趨勢(shì)與技術(shù)融合

隨著質(zhì)譜技術(shù)的進(jìn)步,PMF與MS/MS正在逐漸融合與互補(bǔ):

1、高分辨MALDI-TOF/TOF:MALDI技術(shù)不僅可用于PMF,還能實(shí)現(xiàn)MS/MS碎片檢測(cè),提升信息量;

2、LC-MALDI-MS/MS混合策略:將LC分離與MALDI檢測(cè)結(jié)合,兼顧分離效率與分析速度;

3、AI輔助多肽序列解析:引入深度學(xué)習(xí)模型,提高碎片圖譜解析精度,解決同分異構(gòu)體與復(fù)雜修飾肽段識(shí)別問(wèn)題;

4、單細(xì)胞質(zhì)譜技術(shù):推動(dòng)單細(xì)胞水平的肽測(cè)序,為jīngzhǔn醫(yī)學(xué)提供更多維度的數(shù)據(jù)支持。


在肽測(cè)序領(lǐng)域,百泰派克生物科技依托*質(zhì)譜平臺(tái)(包括Orbitrap Fusion Lumos、Q-Exactive HF-X、MALDI-TOF/TOF),結(jié)合自主開(kāi)發(fā)的樣品前處理和數(shù)據(jù)分析流程,提供從PMF到MS/MS的全流程多肽測(cè)序解決方案。為您快速PMF鑒定;高分辨MS/MS測(cè)序;多技術(shù)整合;全鏈路定制服務(wù),以*的儀器平臺(tái)、完善的解決方案和zhuānyè的技術(shù)團(tuán)隊(duì),為全球客戶提供jīngzhǔn、可靠的肽測(cè)序服務(wù),共同推動(dòng)蛋白組學(xué)與生物醫(yī)藥領(lǐng)域的創(chuàng)新發(fā)展。


百泰派克生物科技特色項(xiàng)目


一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù),包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù),對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。


※服務(wù)優(yōu)勢(shì):

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、蛋白zhìzǔxué

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC,提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白zhìzǔxué分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。


※服務(wù)優(yōu)勢(shì):

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。



三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。


※服務(wù)優(yōu)勢(shì):

1.技術(shù)*,*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題??稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征,百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。



百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

PMF vs MS/MS:多肽測(cè)序技術(shù)原




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計(jì)量/期間核查,軟件審計(jì)追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù);

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái),滿足您一站式服務(wù)需求;

5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!



PMF vs MS/MS:多肽測(cè)序技術(shù)原理與應(yīng)用解析檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

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