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當(dāng)前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測技術(shù)服務(wù)>>蛋白分析>> 適用于小鼠組織樣本的DIA-MS定量蛋白
產(chǎn)品型號
品 牌百泰派克
廠商性質(zhì)其他
所 在 地北京市
更新時間:2025-06-16 16:19:09瀏覽次數(shù):62次
聯(lián)系我時,請告知來自 化工儀器網(wǎng)Bottom-Up蛋白質(zhì)組學(xué)在生物標(biāo)志物
Bottom-Up蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析流程
糖蛋白組學(xué)在藥物開發(fā)中的應(yīng)用檢測技術(shù)服務(wù)
糖蛋白質(zhì)組學(xué)定量分析的原理與常用技術(shù)解析
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在生命科學(xué)研究中,小鼠模型因其遺傳背景清晰、實驗操作成熟,是解析疾病機制和篩選生物標(biāo)志物的重要工具。不同組織(如肝臟、腦組織、心臟等)承載著多樣的生物功能,其dànbáizhì表達(dá)譜的變化直接反映生理或病理狀態(tài)。組織樣本在蛋白組層面具有高復(fù)雜度和廣泛的動態(tài)范圍,依賴性強的采集策略(如DDA)在覆蓋率和重復(fù)性方面存在局限。因此,DIA-MS(Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry)技術(shù)正成為組織蛋白組研究的理想選擇,尤其在多組織對比、動態(tài)監(jiān)測與機制研究中展現(xiàn)出dútè優(yōu)勢。
一、DIA-MS:組織dànbáizhì組學(xué)的技術(shù)變革
DIA-MS是一種全掃描、不依賴預(yù)設(shè)目標(biāo)的質(zhì)譜采集模式,能夠在單次運行中捕獲所有母離子及其碎片信息。其核心優(yōu)勢在于:
數(shù)據(jù)完整性更強:不會因采集策略隨機性而遺漏低豐度信號
分析重復(fù)性更好:適合進行多樣本或時間序列比較
深度覆蓋更廣:可穩(wěn)定檢測數(shù)千種蛋白,尤其對低豐度調(diào)控因子敏感
對于小鼠組織樣本而言,這種全景式掃描策略能夠更jīngzhǔn地捕捉不同組織在功能性蛋白表達(dá)上的微妙差異,有助于深入揭示組織特異性響應(yīng)與調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
二、樣本制備:組織蛋白組研究的關(guān)鍵一步
小鼠組織蛋白提取的難點主要集中在組織類型間的生化性質(zhì)差異,如脂質(zhì)含量、纖維組織比例和膜蛋白分布等。為了zuì大限度提高蛋白回收率和酶切效率,需根據(jù)組織特性優(yōu)化前處理流程,包括:
合理選擇裂解緩沖液和勻漿方式
嚴(yán)格控制蛋白定量與還原/烷基化條件
采用高效蛋白酶切體系,提高肽段生成效率和一致性
在實際應(yīng)用中,標(biāo)準(zhǔn)化的前處理流程對于DIA-MS的定量精度起著決定性作用,直接影響蛋白覆蓋率和數(shù)據(jù)可重復(fù)性。
三、DIA-MS平臺策略與分析流程
成功的DIA-MS方案依賴于高性能質(zhì)譜平臺與系統(tǒng)化的數(shù)據(jù)處理流程。核心要點包括:
1、質(zhì)譜參數(shù)設(shè)置
選擇適用于高通量分析的DIA窗口方案,兼顧分辨率與采集速度
利用高分辨質(zhì)譜(如Orbitrap或TripleTOF)確保肽段識別準(zhǔn)確性
搭配中等以上梯度長度(如60–90分鐘)提升色譜分離度
2、數(shù)據(jù)分析與定量
可采用有庫(library-based)或無庫(library-free)策略進行數(shù)據(jù)解析
軟件工具(如Spectronaut、DIA-NN、Scaffold DIA等)可實現(xiàn)jīngzhǔn的肽段識別與歸一化處理
結(jié)合iRT標(biāo)準(zhǔn)品實現(xiàn)保留時間校準(zhǔn),提高跨樣本對齊一致性
從原始數(shù)據(jù)提取到蛋白定量輸出的整個流程,應(yīng)遵循高一致性、高保真度的標(biāo)準(zhǔn),以適應(yīng)下游的差異分析和功能富集。
隨著DIA-MS技術(shù)的成熟,小鼠組織蛋白組學(xué)已突破傳統(tǒng)定量的瓶頸,向著高通量、高重復(fù)性與多維度數(shù)據(jù)融合的方向發(fā)展。這不僅提升了對疾病機制的解析深度,也加速了生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)與藥效機制研究的效率。百泰派克生物科技致力于提供高質(zhì)量的DIA定量dànbáizhì組學(xué)服務(wù),覆蓋從樣本前處理、質(zhì)譜采集到生信分析的全流程服務(wù)。歡迎聯(lián)系我們獲取項目咨詢與合作建議。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進行分析。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;
2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;
3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復(fù)度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.技術(shù)優(yōu)良,*技術(shù)空白
采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細(xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。
2.分析數(shù)量大,成本較低
單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。
3.應(yīng)用前景大
①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。
百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。
1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);
2.獲國家CNAS實驗室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);
3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;
4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;
5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!
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