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當(dāng)前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測技術(shù)服務(wù)>>蛋白分析>> 高效C端測序策略:提升準(zhǔn)確性與靈敏度
產(chǎn)品型號
品 牌百泰派克
廠商性質(zhì)其他
所 在 地北京市
更新時間:2025-06-06 13:35:00瀏覽次數(shù):87次
聯(lián)系我時,請告知來自 化工儀器網(wǎng)Bottom-Up蛋白質(zhì)組學(xué)在生物標(biāo)志物
Bottom-Up蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析流程
糖蛋白組學(xué)在藥物開發(fā)中的應(yīng)用檢測技術(shù)服務(wù)
糖蛋白質(zhì)組學(xué)定量分析的原理與常用技術(shù)解析
基于標(biāo)記的糖蛋白質(zhì)組學(xué)定量策略全解析
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dànbáizhì的C端(C-terminus)不僅決定了其在細(xì)胞內(nèi)的定位、穩(wěn)定性及活性,還參與多種關(guān)鍵生物過程,如泛素化降解、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控、剪切激活等。相較于蛋白N端,C端的結(jié)構(gòu)更為多樣,且常常涉及翻譯后修飾或與其他分子相互作用,是探索新型藥物靶點(diǎn)、揭示疾病機(jī)制的重要入口。然而,C端肽段的檢測一直面臨技術(shù)瓶頸。傳統(tǒng)dànbáizhì組學(xué)方法難以有效富集和解析C端信息,原因包括酶解位點(diǎn)分布不均、肽段長度短、質(zhì)譜響應(yīng)性低等。如何構(gòu)建一套高靈敏、高特異、高通量的Cduāncèxù策略,成為當(dāng)前dànbáizhì組學(xué)領(lǐng)域的重要課題。
一、Cduāncèxù的技術(shù)難點(diǎn)
1、非特異性酶解干擾C端識別
常用的yídànbáiméi(Trypsin)在堿性氨基酸殘基(K、R)處切割,產(chǎn)生的肽段常包含中間區(qū)域信息。由于C端多為酸性或非極性殘基,缺乏特異性酶切位點(diǎn),導(dǎo)致測序過程中C端肽段容易被其他中間肽段“淹沒",影響識別效率。
2、C端肽段性質(zhì)復(fù)雜,質(zhì)譜響應(yīng)性低
C端肽段常常短小、疏水,或者存在翻譯后修飾(如羧基酰胺化、磷酸化),這使得其在質(zhì)譜中離子化效率差、信噪比低,即便被捕獲也難以高置信度鑒定。
3、缺乏靶向富集策略
大多數(shù)dànbáizhì組學(xué)策略依賴全肽段非選擇性分析,缺乏專一富集C端的手段,導(dǎo)致覆蓋率和特異性難以兼顧。
二、化學(xué)標(biāo)簽策略:實(shí)現(xiàn)C端肽段高效富集
為解決上述挑戰(zhàn),研究者開發(fā)了多種基于化學(xué)標(biāo)記與純化的C端富集方法,主要分為以下兩類:
1、羧基選擇性修飾與阻斷
利用羧基選擇性反應(yīng)(如2-PCA、EDC/NHS耦合)可在蛋白C端或肽段羧基位置添加特定標(biāo)簽。這些標(biāo)簽可進(jìn)一步用于純化、富集、或者阻斷非目標(biāo)位點(diǎn)的反應(yīng),從而提高C端特異性。
2、固相結(jié)合與選擇性洗脫
通過化學(xué)修飾后將C端肽段固定于固相載體(如親和樹脂、磁珠),在酶解或洗脫過程中選擇性釋放C端肽段。這種方法可有效剔除背景中間肽段,提高目標(biāo)識別率。
??這些策略不僅提升了C端肽段的相對豐度,還大大增強(qiáng)了質(zhì)譜檢測靈敏度,為下游高通量分析創(chuàng)造條件。
三、質(zhì)譜平臺升級:從DDA到DIA的跨越
1、DIA模式下C端識別更全面
Data-Independent Acquisition(DIA)技術(shù)近年來快速發(fā)展,其全譜采集模式顯著提升了低豐度肽段的檢測能力。相比傳統(tǒng)的Data-Dependent Acquisition(DDA),DIA不再依賴采集強(qiáng)度選擇目標(biāo),而是對所有肽段信號一網(wǎng)打盡。結(jié)合針對C端肽段構(gòu)建的特征譜圖庫,DIA可實(shí)現(xiàn)jīngzhǔn識別與定量,尤其適合復(fù)雜樣本中的C端特異性檢測。
2、高分辨質(zhì)譜平臺帶來jīngzhǔn測序
如Orbitrap Exploris 480、Q Exactive HF-X等gāoduān質(zhì)譜儀具備更高分辨率、更快掃描速度和更寬動態(tài)范圍,能清晰分辨低豐度、相似質(zhì)量的C端肽段。配合納流LC系統(tǒng),極大提升了整體靈敏度與數(shù)據(jù)重現(xiàn)性。
四、生信算法與數(shù)據(jù)庫優(yōu)化:補(bǔ)齊識別盲區(qū)
1、自定義數(shù)據(jù)庫匹配提高準(zhǔn)確性
傳統(tǒng)數(shù)據(jù)庫多以全蛋白序列構(gòu)建,針對C端位點(diǎn)的識別靈敏度不足。通過引入特定“decoy"序列、模擬C端剪切形式,可提升搜索引擎對真實(shí)C端的識別能力。
2、AI算法提升譜圖識別率
隨著機(jī)器學(xué)習(xí)與深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的引入,生信平臺可對弱信號譜圖進(jìn)行智能二次打分。即便是低質(zhì)量、弱響應(yīng)的C端肽段,也可通過模型識別出潛在結(jié)構(gòu),從而顯著降低假陰性率。
??這些策略為Cduāncèxù提供了數(shù)據(jù)層面的保障,使整個流程更智能、高效。
隨著dànbáizhì組學(xué)技術(shù)的不斷演進(jìn),Cduāncèxù正逐步從“小眾難題"邁向“大規(guī)模應(yīng)用"。通過整合化學(xué)富集策略、優(yōu)良質(zhì)譜平臺與智能算法支持,研究者得以實(shí)現(xiàn)對蛋白C端的高靈敏、高通量解析。百泰派克生物科技構(gòu)建了標(biāo)準(zhǔn)化、高通量的Cduāncèxù平臺,已服務(wù)于多家科研院所與生物醫(yī)藥企業(yè),為蛋白功能研究與藥物開發(fā)提供有力支持。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進(jìn)行分析。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實(shí)現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;
2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;
3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.技術(shù)優(yōu)良,*技術(shù)空白
采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭?xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時進(jìn)行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。
2.分析數(shù)量大,成本較低
單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。
3.應(yīng)用前景大
①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。
百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。
1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);
2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);
3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;
4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;
5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!
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