基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)測序：原理與優(yōu)勢檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在jīngzhǔn醫(yī)學(xué)、生物制藥、基礎(chǔ)研究不斷深化的當(dāng)下，獲取高質(zhì)量的dànbáizhì序列信息已成為生命科學(xué)研究bùkěhuòquē的一環(huán)。dànbáizhì作為生物體功能執(zhí)行的直接承擔(dān)者，其一級結(jié)構(gòu)（氨基酸序列）是理解蛋白功能、研究疾病機制、開發(fā)靶向藥物的基礎(chǔ)。隨著質(zhì)譜技術(shù)的飛躍式發(fā)展，基于質(zhì)譜的dànbáizhì測序（Mass Spectrometry-based Protein Sequencing）已逐步成為研究人員解析蛋白序列的核心工具。

一、dànbáizhì測序的演進與挑戰(zhàn)

早期的dànbáizhì測序主要依賴Edman降解法，該方法通過順序地切除N端氨基酸并加以識別來確定蛋白序列，雖然準確性高，但適用于較短、多肽純度高的樣本，不適合高通量分析。隨著組學(xué)時代的到來，dànbáizhì樣本復(fù)雜性迅速提升，需要更高效、自動化的技術(shù)平臺加以應(yīng)對。質(zhì)譜技術(shù)的興起改變了dànbáizhì測序的格局。通過將蛋白樣品轉(zhuǎn)化為帶電離子的方式，質(zhì)譜能夠提供肽段或蛋白的分子質(zhì)量（mass）和結(jié)構(gòu)信息（fragmentation pattern），配合高精度的數(shù)據(jù)分析算法，可以重構(gòu)蛋白的氨基酸序列，并識別翻譯后修飾、序列變異等關(guān)鍵信息。

二、基于質(zhì)譜的dànbáizhì測序原理

質(zhì)譜dànbáizhì測序過程通常包括以下關(guān)鍵步驟：

1、蛋白樣品預(yù)處理與酶切

dànbáizhì樣品首先需要經(jīng)歷標準化的預(yù)處理流程，包括變性（打破空間結(jié)構(gòu)）、還原（切斷二硫鍵）、烷基化（防止重組）、以及酶切。zuì常使用的酶為yídànbáiméi（Trypsin），其可在賴氨酸（K）或jīngānsuān（R）殘基后切割蛋白，得到一系列適宜質(zhì)譜分析的肽段。

2、液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用（LC-MS/MS）分析

經(jīng)過酶解的肽段通過高效液相色譜（HPLC）分離后，依次進入質(zhì)譜儀進行檢測。電噴霧電離（ESI）將液相中的肽段轉(zhuǎn)化為帶電離子，這些離子隨后被導(dǎo)入質(zhì)譜儀的質(zhì)量分析器中檢測其質(zhì)量-電荷比（m/z）。在串聯(lián)質(zhì)譜（MS/MS）模式下，一級質(zhì)譜（MS1）用于檢測所有肽段的jīngquè質(zhì)量信息，隨后選擇特定離子進行碎裂（通常通過碰撞誘導(dǎo)解離CID或高能碰撞HCD），形成一組具有代表性的二級碎片離子（b離子與y離子系列），用于重建肽段的氨基酸序列。

3、數(shù)據(jù)解析與序列識別

獲取的MS/MS譜圖可通過兩種主要策略解析：

• 數(shù)據(jù)庫匹配（Database Search）：通過比對質(zhì)譜數(shù)據(jù)與已知蛋白數(shù)據(jù)庫（如UniProt、Swiss-Prot），確定匹配的dànbáizhì與肽段。

• de novo測序：對于未知蛋白或數(shù)據(jù)庫缺失的樣本，通過算法直接從MS/MS譜圖中推導(dǎo)出肽段序列，無需依賴已有數(shù)據(jù)庫，特別適用于抗體測序、新物種研究或突變蛋白識別。

三、基于質(zhì)譜的dànbáizhì測序的核心優(yōu)勢

1、高通量、快速、自動化

質(zhì)譜平臺可在單次實驗中分析上千種肽段，實現(xiàn)大規(guī)模dànbáizhì序列的快速獲取，適用于大規(guī)模項目如dànbáizhì組定性、抗體譜分析、功能蛋白篩選等。質(zhì)譜無需逐位識別，極大縮短實驗周期。

2、高靈敏度，支持低豐度蛋白檢測

現(xiàn)代高分辨率質(zhì)譜儀（如Orbitrap、Q-TOF）具備jígāo的靈敏度和動態(tài)范圍，可識別生物樣本中低豐度、微量蛋白，尤其在信號通路研究、疾病標志物發(fā)現(xiàn)等領(lǐng)域具有明顯優(yōu)勢。

3、能解析翻譯后修飾（PTMs）

質(zhì)譜不僅能提供dànbáizhì的氨基酸序列，還可識別并定位多種翻譯后修飾，如磷酸化、乙酰化、甲基化、糖基化等。這些修飾在調(diào)控蛋白功能、細胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、表觀遺傳調(diào)控等方面具有重要生物學(xué)意義。

4、應(yīng)對復(fù)雜樣本的能力強

質(zhì)譜可處理各類復(fù)雜生物樣本，如全細胞裂解物、組織勻漿、血漿等，結(jié)合前端富集、分離策略（如強陽離子交換、離子遷移譜IMS、納升液相色譜等）可極大提升信噪比和檢測通量，適用于復(fù)雜背景下的高質(zhì)量蛋白序列獲取。

四、技術(shù)發(fā)展趨勢與未來方向

當(dāng)前，質(zhì)譜dànbáizhì測序的研究焦點正從單純的序列解析向更高覆蓋率、更深度修飾識別、更高自動化水平轉(zhuǎn)變。包括以下幾個方向：

• 單細胞dànbáizhì測序：結(jié)合微流控和超靈敏MS平臺，正在突破分析靈敏度瓶頸；

• AI輔助譜圖解析：新一代算法（如AlphaPept、Prosit）正推動譜圖自動解讀向更高準確率發(fā)展；

• 原位測序與空間蛋白組學(xué)：結(jié)合成像質(zhì)譜，實現(xiàn)蛋白序列與空間信息的協(xié)同獲??；

• 跨平臺多組學(xué)融合：將質(zhì)譜dànbáizhì測序與轉(zhuǎn)錄組、代謝組等整合，構(gòu)建更全面的生命過程圖譜。

基于質(zhì)譜的dànbáizhì測序以其高通量、jīngzhǔn度高、可識別修飾等顯著優(yōu)勢廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、疾病機制解析、生物藥開發(fā)、抗體工程、功能蛋白篩選等多個領(lǐng)域。隨著儀器硬件與算法軟件的不斷升級，質(zhì)譜測序的邊界還在不斷被拓展。百泰派克生物科技將持續(xù)關(guān)注并推動蛋白測序技術(shù)的創(chuàng)新與轉(zhuǎn)化，助力科研人員更高效、更深入地探索蛋白世界的奧秘。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)測序：原理與優(yōu)勢檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹