Edman降解 vs 質譜：蛋白質測序技術對比（二）檢測技術服務詳情介紹

dànbáizhì作為細胞功能的核心執(zhí)行者，其氨基酸序列信息不僅揭示其結構與功能，還為生物標志物發(fā)現(xiàn)、抗體鑒定、疫苗設計等應用提供基礎。dànbáizhì測序，作為解析氨基酸組成與排列的關鍵技術，歷經數(shù)十年發(fā)展，主要形成了兩種主流路徑：Edman降解法與質譜（Mass Spectrometry, MS）法。那么，這兩種dànbáizhì測序技術各有何優(yōu)勢，又適用于哪些研究場景？本文將為您全面對比解析。

一、什么是Edman降解？

Edman降解是由Pehr Edman于1950年開發(fā)的一種經典dànbáizhì測序技術，原理是通過化學方式依次從N端切割出氨基酸，并加以鑒定，從而一步步推斷蛋白序列。

1、核心機制

（1）PITC標記：苯異硫氰酸酯（PITC）與N端氨基酸反應形成環(huán)狀衍生物；

（2）酸解切除：釋放出dìyī個氨基酸衍生物（PTH-aa）；

（3）高效液相色譜（HPLC）分析：鑒定該氨基酸種類；

（4）重復上述步驟，逐個讀取氨基酸。

2、優(yōu)點

（1）高保真度，適用于序列已知或抗體驗證；

（2）適用于純化程度高的dànbáizhì；

（3）對序列中氨基酸修飾不敏感。

3、局限

（1）通常只能測定前30–50個氨基酸；

（2）要求樣品純度高，量大；

（3）對C端及中段序列無能為力；

（4）無法識別翻譯后修飾（PTMs）。

二、什么是質譜蛋白測序？

質譜法測序是通過對dànbáizhì或肽段的質量-電荷比（m/z）進行jīngquè測定，結合數(shù)據(jù)庫搜索或de novo算法，實現(xiàn)蛋白序列解析的現(xiàn)代技術路徑。

1、核心流程

（1）蛋白酶切：如yídànbáiméi水解蛋白成小肽；

（2）LC-MS/MS分析：液相色譜分離 + 串聯(lián)質譜碎裂肽段；

（3）數(shù)據(jù)庫匹配或de novo算法推斷序列。

2、優(yōu)點

（1）高通量：可同時測定上千種dànbáizhì；

（2）靈敏度高：納克級甚至皮克級樣本也能測序；

（3）識別翻譯后修飾：如磷酸化、乙?；?、糖基化等；

（4）適配復雜樣本：如細胞裂解液、組織提取物、血漿等。

3、局限

（1）對小肽（< 5 aa）難以解析；

（2）de novo算法結果需驗證，存在一定不確定性；

（3）復雜修飾、異構體可能增加鑒定難度。

三、二者比較一覽

四、dànbáizhì測序技術選擇建議

若您手頭擁有高純度單一蛋白，并希望驗證其N端序列或抗體片段，Edman降解仍具價值；

若您關注整體蛋白表達譜、翻譯后修飾、或進行未知蛋白序列測定，質譜法則是更現(xiàn)代、高效的選擇。

在dànbáizhì測序需求日益增長的jīntiān，選擇可靠的實驗平臺至關重要。百泰派克生物科技依托優(yōu)良的Orbitrap與Q-TOF質譜平臺，提供涵蓋N/C端測序、de novo肽段測序、翻譯后修飾分析等多樣化服務。我們不僅滿足科研人員的基礎需求，更助力生物醫(yī)藥企業(yè)推進抗體藥物研發(fā)、疫苗驗證與創(chuàng)新蛋白設計。無論您是科研單位、醫(yī)院研究者，還是生物醫(yī)藥企業(yè)，歡迎聯(lián)系我們，一站式解決dànbáizhì測序難題。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，N端測序，C端測序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統(tǒng)進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數(shù)據(jù)轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術優(yōu)良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優(yōu)質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質的生物質譜分析服務!

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