自下而上和自上而下蛋白質(zhì)組學(xué)的全面解析檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

自下而上和自上而下蛋白質(zhì)組學(xué)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中的兩種主要策略，旨在解析蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)、功能以及相互作用。自下而上蛋白質(zhì)組學(xué)（Bottom-Up Proteomics）主要是通過(guò)蛋白質(zhì)的酶解，將復(fù)雜的蛋白質(zhì)樣本分解成更小的肽段，再通過(guò)質(zhì)譜等高靈敏度的分析技術(shù)對(duì)這些肽段進(jìn)行識(shí)別和定量分析。這種方法的核心在于通過(guò)肽段的信息反推整個(gè)蛋白質(zhì)的性質(zhì)和功能。因此，自下而上蛋白質(zhì)組學(xué)在大規(guī)模蛋白質(zhì)識(shí)別、定量和功能解析方面具有廣泛的應(yīng)用。 與之相對(duì)的，自上而下蛋白質(zhì)組學(xué)（Top-Down Proteomics）則是直接對(duì)完整蛋白質(zhì)進(jìn)行分析。這種方法避免了蛋白質(zhì)酶解可能帶來(lái)的信息丟失問(wèn)題，能夠提供關(guān)于蛋白質(zhì)修飾、異構(gòu)體和亞型的詳細(xì)信息。自上而下蛋白質(zhì)組學(xué)在研究蛋白質(zhì)多態(tài)性、翻譯后修飾以及蛋白質(zhì)復(fù)合物的結(jié)構(gòu)分析中具有dútè的優(yōu)勢(shì)。因此，兩者在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中有著互補(bǔ)的作用，結(jié)合使用能更全面地揭示蛋白質(zhì)的生物學(xué)意義。

一、自下而上蛋白質(zhì)組學(xué)

先使用酶（如yídànbáiméi）將蛋白質(zhì)樣本水解成小肽段，再對(duì)這些肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析，zuì后根據(jù)肽段的質(zhì)譜數(shù)據(jù)推測(cè)原始蛋白質(zhì)的序列。

1、步驟

（1）酶解：選擇合適的蛋白酶將蛋白質(zhì)切割成較小的肽段。

（2）分離：通過(guò)一維或多維色譜技術(shù)對(duì)酶解后的肽段混合物進(jìn)行分離。

（3）質(zhì)譜分析：將分離后的肽段送入質(zhì)譜儀，得到肽段的質(zhì)荷比等數(shù)據(jù)。

（4）數(shù)據(jù)庫(kù)匹配：將質(zhì)譜數(shù)據(jù)與已知的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)，識(shí)別出樣品中的蛋白質(zhì)。

2、優(yōu)點(diǎn)

（1）高通量：能夠同時(shí)處理大量的蛋白質(zhì)樣品，快速鑒定出大量蛋白質(zhì)。

（2）適合復(fù)雜樣本：對(duì)于復(fù)雜的蛋白質(zhì)混合物，如細(xì)胞裂解液等，能有效進(jìn)行分析。

（3）技術(shù)成熟：經(jīng)過(guò)多年發(fā)展，相關(guān)技術(shù)和方法已經(jīng)比較成熟，實(shí)驗(yàn)操作相對(duì)簡(jiǎn)單。

3、缺點(diǎn)

（1）修飾信息丟失：在酶解過(guò)程中，可能會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)的翻譯后修飾信息丟失或難以準(zhǔn)確判斷修飾位點(diǎn)。

（2）結(jié)構(gòu)信息不完整：蛋白質(zhì)被切割成肽段后，無(wú)法直接得到蛋白質(zhì)的整體結(jié)構(gòu)信息，難以研究蛋白質(zhì)的gāojí結(jié)構(gòu)和蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。

（3）肽段偏好性：某些肽段可能由于自身特性，在酶解、分離或質(zhì)譜分析過(guò)程中存在偏好性，導(dǎo)致部分蛋白質(zhì)的鑒定不準(zhǔn)確或無(wú)法鑒定。

4、適用場(chǎng)景

（1）大規(guī)模蛋白質(zhì)鑒定：在對(duì)未知蛋白質(zhì)組進(jìn)行普查，快速確定樣品中存在哪些蛋白質(zhì)時(shí)非常有效。

（2）蛋白質(zhì)定量分析：如比較不同細(xì)胞狀態(tài)、不同組織或不同疾病樣本中的蛋白質(zhì)表達(dá)量變化。

（3）生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)：從大量蛋白質(zhì)中篩選出與疾病或生理過(guò)程相關(guān)的潛在生物標(biāo)志物。

二、自上而下蛋白質(zhì)組學(xué)

直接對(duì)完整的、未經(jīng)消化的蛋白質(zhì)進(jìn)行分析，通過(guò)質(zhì)譜儀測(cè)量出蛋白質(zhì)的分子量和結(jié)構(gòu)等信息。

1、步驟

（1）蛋白質(zhì)分離：采用液相色譜或 2-D 凝膠電泳等技術(shù)從復(fù)雜的生物樣品中分離出完整的蛋白質(zhì)。

（2）質(zhì)譜分析：將完整蛋白質(zhì)直接送入質(zhì)譜儀，利用電噴霧電離（ESI）或基質(zhì)輔助激光解吸電離（MALDI）等軟電離方法將蛋白質(zhì)離子化，再通過(guò)多種解離方法如高能碰撞引入解離（HCD）、電子捕獲解離（ECD）和電子轉(zhuǎn)移解離（ETD）產(chǎn)生碎片，進(jìn)行質(zhì)譜分析。

2、優(yōu)點(diǎn)

（1）完整信息保留：能夠保留蛋白質(zhì)的完整結(jié)構(gòu)信息，包括翻譯后修飾（如磷酸化、甲基化等）以及蛋白質(zhì)異構(gòu)體或亞型的信息。

（2）直接分析：無(wú)需酶解等預(yù)處理步驟，減少了實(shí)驗(yàn)操作過(guò)程中的誤差和信息丟失風(fēng)險(xiǎn)，可直接檢測(cè)生物蛋白質(zhì)的分子量。

（3）研究蛋白質(zhì)復(fù)合物：對(duì)于蛋白質(zhì)復(fù)合物的分析優(yōu)勢(shì)明顯，能夠發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)復(fù)合物及其翻譯后修飾的組合形式。

3、缺點(diǎn)

（1）技術(shù)要求高：對(duì)于大分子蛋白質(zhì)的分離和分析較為困難，需要高分辨率和高精度的質(zhì)譜儀。

（2）通量較低：相比自下而上蛋白質(zhì)組學(xué)，分析速度較慢，難以進(jìn)行大規(guī)模的蛋白質(zhì)分析。

（3）數(shù)據(jù)處理復(fù)雜：得到的質(zhì)譜數(shù)據(jù)相對(duì)復(fù)雜，解析難度較大，需要更優(yōu)良的數(shù)據(jù)處理軟件和技術(shù)。

4、適用場(chǎng)景

（1）蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)研究：需要jīngquè了解蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)、折疊狀態(tài)以及二硫鍵等結(jié)構(gòu)特征時(shí)。

（2）翻譯后修飾研究：深入研究蛋白質(zhì)的翻譯后修飾類型、位點(diǎn)和修飾程度，以及修飾之間的相互關(guān)系。

（3）蛋白質(zhì)異構(gòu)體分析：區(qū)分和鑒定蛋白質(zhì)的不同異構(gòu)體或亞型，研究其在生理和病理過(guò)程中的作用。

百泰派克生物科技在自下而上和自上而下蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域提供全面的分析服務(wù)。我們擁有經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)團(tuán)隊(duì)，能夠根據(jù)客戶的研究需求制定個(gè)性化的蛋白質(zhì)組學(xué)解決方案。無(wú)論是大規(guī)模的蛋白質(zhì)鑒定還是復(fù)雜蛋白質(zhì)的深度解析，百泰派克始終致力于為客戶提供高質(zhì)量、可靠的研究結(jié)果。歡迎與我們合作，共同推進(jìn)蛋白質(zhì)組學(xué)研究的前沿探索。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)蛋白質(zhì)序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)蛋白質(zhì)的氨基酸組成分析，N端測(cè)序，C端測(cè)序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白質(zhì)N端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的蛋白質(zhì)，提供基于從頭測(cè)序法的蛋白質(zhì)從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白質(zhì)組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白質(zhì)組學(xué)、靶向蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種蛋白質(zhì)標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從蛋白質(zhì)、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

自下而上和自上而下蛋白質(zhì)組學(xué)的全面解析檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹