全自动核酸质谱检测系统是样品分析物与芯片基质（硅化合物）共价结合形成结晶后在质谱仪的真空腔中经高能激光激发，核酸分子解吸附为单电荷离子；在电场中离子飞行时间与离子的质量成反比相关，通过检测解吸的核酸分子在真空腔中飞行的时间从而计算获得样品分析物的准确分子量，进而得到分析物的基因型信息。该平台使用的是垂直飞行模式。
全自动核酸质谱检测系统的主要原理是利用已知菌种建立数据库，通过质谱检测获得细菌核糖体蛋白的指纹图谱，将其与数据库中的参考图谱比对后得到鉴定结果。
质谱分析在医学临床诊断和研究方面变得非常普遍，我们可能经?；崽接肵X质谱分析在临床检验某种遗传代谢性疾病，提及质谱我们一般都会想到气相色谱质谱联用、串联质谱、遗传代谢病、代谢组学（有机酸、氨基酸、脂肪酸等）等。
在基质辅助下使结合后的分子发生电离，产生的离子在电场作用下加速通过飞行管道，它们的质量和所带电荷可以影响其飞行时间，因此，根据它们到达检测器飞行时间的不同对待检测物进行分离。
PCR技术、测序和基因芯片，他们的主要区别在于。PCR，包括其它qPDR、dPCR以及LAMP、RPA等是利用酶进行核酸分子的扩增从而达到检测这个分子的目的，不同技术在于信号读取和反应条件不同，应用范围也有所差异。
测序，包括一代，二代NGS，nanopore等是利用某种技术，把核酸分子的序列给测出来，从而得到基因的序列信息?；蛐酒腔诤怂岱肿恿粗涞幕ゲ构叵等ゴ蠊婺５纳秆〕鑫颐窍氲玫降幕蛐畔?。
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