多肽固相合成技术的发明同时促进了肽合成的自动化。真正意义上的多肽合成仪出现在1960年代末至1970年代初期，它是利用氮气鼓泡或者震荡来对反应物进行搅拌，用计算机程序控制来实现有限度的自动合成。即为后来总结归纳出的第一代多肽合成仪。虽然在搅拌方式和其他各项功能方面有着明显的缺陷，但是它毕竟把人从实验室里解放出来，极大地提高了工作效率，所以受到了多肽科学家的一致赞扬。
 

　　多肽合成仪的运行原理：
 

　　多肽合成仪以固相合成为反应原理，在密闭的防爆玻璃反应器中使氨基酸按照已知顺序(序列，一般从C端-羧基端 向 N端-氨基端)不断添加、反应、合成，操作最终得到多肽载体。固相合成法，大大的减轻了每步产品提纯的难度。为了防止副反应的发生，参加反应的氨基酸的侧链都是保护的。羧基端是游离的，并且在反应之前必须活化。固相合成方法有两种，即Fmoc和tBoc。由于Fmoc比tBoc存在很多优势，现在大多采用Fmoc法合成，但对于某些短肽，tBoc因其产率高的优势仍然被很多企业所采用。
 

　　多肽合成仪具体合成由下列几个循环组成：
 

　　1) 去?；ぃ篎moc保护的柱子和单体必须用一种碱性溶剂(piperidine)去 除氨基的?；せ?。
 

　　2) 激活和交联：下一个氨基酸的羧基被一种活化剂所活化?；罨牡ヌ逵胗卫氲陌被从涣?，形成肽键。在此步骤使用大量的超浓度试剂驱使反应完成。循环：这两步反应反复循环直到合成完成。
 

　　3) 洗脱和脱保护：多肽从柱上洗脱下来，其保护基团被一种脱?；ぜ?TFA) 洗脱和脱保护。