运行原理：
 

　　多肽合成仪以固相合成为反应原理，在密闭的防爆玻璃反应器中使氨基酸按照已知顺序(序列，一般从C端-羧基端 向 N端-氨基端)不断添加、反应、合成，操作最终得到多肽载体。固相合成法，大大的减轻了每步产品提纯的难度。为了防止副反应的发生，参加反应的氨基酸的侧链都是?；さ?。羧基端是游离的，并且在反应之前必须活化。
 

　　多肽合成仪基本元件：

 

　　反应器
 

　　数百年来，制药业的反应器/反应釜 设备以玻璃材质最为常见，因其*透明且耐腐蚀，而被众多化学、生物学专家沿用。多肽合成的过程需要操作人员直观监测，同时合成后可进行在线切割(切割试剂TFA的强腐蚀性对反应器材质有了极大限制)，这些要求限制反应器以玻璃材质最为适用?！〔ＡР闹实姆从ζ髟谥圃旃ひ丈嫌屑蟮哪讯认拗疲孩偕罩乒ひ眨耗タ诰纫蟾?，正如很多国产设备都无法达到要求出现漏液漏气现象，玻璃壁均匀程度等。②配合搅拌柄以及密封装置的成套加工工艺③防爆处理
 

　　氨基酸储罐
 

　　用来储存氨基酸粉末或预先活化溶解好的氨基酸溶液。小型合成仪的氨基酸储罐一般在20-40个之间以保证无人监控下的全自动缩合反应顺利进行。大型合成仪根据生产规模的不同，配置也各不相同。
 

　　溶剂储罐
 

　　用来储存多肽合成过程中需要的有机溶液，如DMF,PIP等。
 

　　量筒
 

　　用来测量氨基酸溶液与其他试剂的合成量，需有精密型传感器设计刻度并回传信息至电脑控制程序。因早期的恒压法测定偏差过大且操作繁琐，而采用此方法测定。触发器的数量根据不同客户的要求而定，不同的品牌也略有不同。
 

　　转液瓶
 

　　感应器
 

　　多端触发器自感应定量量取法，直观、科学、相对误差低。代替早期的恒压法，避免了每日进行的大量的数学运算，操作更为简单，测定误差值可控制在1%。
 

　　废液桶
 

　　废液桶通常选择容积较大的HDPE桶，保证通风良好，同时需安装感应器装置时刻检测废液情况，避免溢出。
 

　　控制配件
 

　　电磁阀
 

　　多肽合成仪中的电磁阀属于敏感配件，其控制液路的串联与闭路，在氨基酸转移与量取，溶剂转移与量取两步骤中起到至关重要的作用。不同品牌的合成仪对电磁阀的设计与排布也略有不同。
 

　　控制面板
 

　　控制面板内往往含有光敏组建，部分控制电磁阀以及感应器控制组。与电脑主机的控制系统、合成仪统一的链接在一起，完成多肽合成的全过程。
 

　　软件系统
 

　　多肽合成仪的操作软件。不同品牌合成仪所注册的软件也不同。