番茄内标准Apx基因探针法qPCR试剂盒实验操作步骤
在完成反应体系配制后,将PCR管或96孔板短暂离心,确保液体集中于管底,避免气泡干扰。随后将反应板置于qPCR仪中,按照以下程序设置扩增条件:
1. 预变性阶段:95℃维持30秒,充分激活DNA聚合酶并打开模板二级结构;
2. 循环扩增阶段:95℃变性5秒,60℃退火/延伸30秒(根据引物Tm值可微调),重复40个循环;
3. 熔解曲线分析(可?。捍?0℃缓慢升温至95℃,每0.5℃采集一次荧光信号,验证扩增特异性。
实验过程中需注意:
- 阴性对照:设置无模板对照(NTC)以排除污染风险;
- 重复孔:每个样本至少设3个技术重复,确保数据可靠性;
- 荧光通道选择:若使用探针法,需匹配仪器FAM/HEX等通道,避免信号串扰。
数据分析时,采用ΔΔCt法计算目标基因相对表达量。首先用内参基因(如Actin)Ct值校正样本间差异,再通过实验组与对照组的Ct差值比较获得表达倍数变化。若熔解曲线出现多峰或阴性对照出现扩增,需排查引物二聚体或污染问题。
为提高实验成功率,建议在正式实验前进行预实验优化退火温度及引物浓度。此外,试剂盒开封后需分装保存,避免反复冻融影响酶活性。通过严谨的操作流程和质控步骤,可确保番茄Apx基因表达分析的准确性和重复性。
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