1)取出培育器先检查包装是否完好无损，在无菌室内翻开塑料包装袋。
(2)将培育器逐一插放在不锈钢座上。
(3)将集菌培育器的弹性软管装入智能集菌仪泵头，要求定位准确，软管走势顺利。
(4)翻开待检样品的瓶盖插针孔并消毒之，(若检测安瓿样品，先将安瓿颈部消毒，然后翻开并将安瓿)样品瓶定位。
(5)拔去进样双芯针管之护套，插入样品瓶中，敞开集菌仪，施行过滤集菌(应防止双芯针管进气，滤膜被药液浸湿，影响进气)。
(6)完结集菌后，若样品含抑菌物质，按药典 规范要求适当用冲洗液清洗，清洗方法与集菌过程相同。
(7)消毒培育基瓶插针孔处。
(8)摘下顶部空气滤器开口的胶塞，套在培育器底口上，用软管夹子，顺次开闭软管，敞开集菌仪，将培育基泵入zhi定的培育器内。
(9)用夹片夹闭与培育器衔接部的软管，留下5～6cm软管，剪除其余部分，并将开口端插在空气过滤器开口上。
(10)别离按规则进行培育。
(11)调查培育状况，若需取样别离培育，可将软管消毒，用无菌注。