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1、调节载气系统压力和流量
打开载气（气体发生器或钢瓶）和压缩空气钢瓶高压开关后，首先调低色谱仪载气系统的柱头压力到0.01Mpa，然后把顶空进样器的进样针插入色谱仪的注样口内（用随机支架固定进样针套管），然后通过调节顶空进样器前面板的稳压阀来满足色谱仪所需的柱流量；对于毛细管柱系统，当使用内径小于0.32mm的毛细管时，色谱仪应采用分流进样模式；对于配备电子流量/电子压力控制的气相色谱仪，推荐色谱仪使用恒流模式，然后根据色谱仪的柱头压力来调节顶空进样器载气压力，并使其稍高于色谱仪柱头压力即可。
2、设定色谱仪工作状态
根据检测所需的检测器、色谱柱、和要分析的样品种类设定色谱仪的工作条件（注样器温度、色谱柱温度、检测器温度）。
3、设定柱温箱、阀箱、管路温度
打开顶空进样器的电源开关，电气系统自检后，通过按键盘上的“样品”、“阀箱”、“管路”、数字键以的及“输入”键，根据分析要求分别输入需要的样品、阀箱、管路的温度值（为避免样品在传输时发生冷凝现象），阀箱、管路温度高于样品温度20-25℃）。
4、放置样品瓶
当温度达到设定值后,，稳定10分钟,，再将密封好的装有样品的顶空瓶放入印有号码的加热筒中，平衡30分钟。顶空瓶内的样品量一般不要超过顶空瓶容量的1/2，当样品的恒温温度高于100℃时，请注意选择合适的溶剂，以免瓶内压力过高造成密封垫漏气或瓶子破损。同时，请带手套拿取瓶子以免烫伤。
5、吹洗取样针
拿住取样针管,同时按下面板上的“吹洗”键,吹洗气将吹洗取样系统中的空气或上次取样的残余气（此时,吹洗状态灯红色亮），再次按面板上的“吹洗”键，吹洗电磁阀关闭（此时,吹洗状态灯红色灭）。吹洗时间应根据样品的浓度来确定，一般情况10～20秒左右，当样品浓度较高时，适当延长吹洗时间。
6.顶空温度设定
（1）样品炉温
样品平衡温度极大地影响分析物在顶空气相中的浓度。总的来说，增加炉温，进入气相色谱的分析物量和方法的灵敏度都增加。确保安全操作和满足所需分析灵敏度前提下，炉温提高能获得好的结果。
（2）进样阀温度
应设定阀箱温度稍高于炉温20℃～25℃以获得最高的准确度。
（3）传输管温度
应设定传输管温度等于或高于进样阀温度20℃～25℃。
7.气体调节
载气流速应设定足够高的载气流速把顶空样品吹出样品定量环载入色谱，避免流速过低造成峰形展宽。对填充柱色谱，标准的30mL/min载气流量就可；当使用毛细柱时，最好开启柱头分流，提高样品气传输的流速，减少流速过低造成峰形展宽。但是大流量将影响柱容量和分流比：分流率越高，结果灵敏度越低，因此要求适当地调节载气流速。吹扫气压力设定为0.2～0.3Mpa。
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