①毛细管柱内径较小，一般为0.1～0.7mm，内壁固定液膜极薄，中心是空的，故阻力很小，而且涡流扩散项不存在，谱带展宽变小。由于毛细管柱的阻力很小，其长度可为填充柱的几十倍，其总柱效比填充柱高得多。一般来说，一根30m长的毛细管柱很容易达到100000的总理论塔板数，而一根3m长的填充柱却最多只有4500的总柱效。

②毛细管柱的分析速度约为填充柱的数十倍。由于液膜极薄，分配比k很小，相比大，组分在固定相中的传质速度极快，因此有利于提高柱效和分析速度。它可在1小时内分离出包含一百多种化合物的汽油成分；可在几分钟内分离十几种化合物。所以毛细管色谱柱对于复杂的样品分离更为有利，如农产品中的农药多残留同时检测、环境样品的有机物污染检测、化妆品中香精检测等。

当然，毛细管柱也有其局限性。因其内径小，柱容量小，且对进样技术的要求更高，载气流速的控制要求更为精确。进样量越小，意味着对检测器的灵敏度要求就更高。所以考虑到分析工作中成本和经济效益，在进行简单的永久气体分析和低分子量有机化合物分析时，建议采用填充气相色谱柱。