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种子发芽箱是在一定程度上满足和提供了种子生长、微生物培养、生化反应等生物学活动所需的温度、光照、气体和水分条件，而其核心则是温度控制。种子发芽箱把制冷和加热二个系统融和在一起。
种子发芽箱采用功率较高、性能稳定的旋转式压缩机，确保在任何环境温度下达到试验所需的低温，加热系统则通过可控硅的控制，保证长时间的恒温。控制系统中由于采用了精密的集成电路温度传感器，整机电路的高度集成化，以及实行了测温、控温电路的二合一，使本机在较大程度上具备了测温精度高、纯性优良、重复性好、工作稳定等优点，从而使操作调节自如。
种子发芽箱的一些运用事项如下：
1.种子发芽箱虽是采用微电脑控制技术、人工模拟自然生态环境的新型试验设备，但箱内各层的温度存在差异，同一层的里面和外面的温度也存在差异，那些容积较大的培养箱内的各部位的温度均是存在一定的差别的，在使用时应引起高度重视。
2.从测量结果来看，培养箱的最上一层温度并不是最高的，箱体中部的温度较高。
3.种子发芽箱箱体内实际温度与箱体显示温度和设定温度之间都存在差异，箱体内实际温度一般都小于箱体显示温度和设定温度，在实际工作中需用温湿度记录仪来校正。
4.样品数量较少和做水稻发芽检测等体积较小的实验时，应多使用容积较小、温度较均匀的种子发芽箱。
5.样品数量较多和做体积较大的实验时需用容积较大、温度难均匀的培养箱时，应特别注意按照实验对象对温度的要求不同来进行合理的放置，以确保箱内的温度都能够满足不同作物的需求；其次最上一层和最下一层最好不要放置样品。若样品数量较多且必须使用时，应定时将最上一层和最下一层的样品与中间温度较高区域的样品调换，以使各区域的样品能同步发育，在规定的初/末次计数天数内完成检测工作。
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