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新品速递!基于NGS的甲基化检测方案,助力肿瘤标志物的开发

阅读:113      发布时间:2024-11-20
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表观遗传学(Epigenetics)是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下,基因表达的可遗传变化的一门学科。DNA甲基化是哺乳动物基因组中发生的表观遗传事件之一。DNA分子(胞嘧啶)的甲基化会影响基因表达。研究表明,DNA甲基化模式和临床表型之间有着非常紧密的联系,可以用作疾病诊断和指导治疗的生物标志物,甲基化失衡与肿瘤进程关系密切。
 

赛默飞重磅推出Ion AmpliSeq™ 甲基化检测方案

为此,赛默飞推出用于癌症研究的Ion AmpliSeq™ 甲基化检测方案,用于研究gDNA或FFPE 样本gDNA特定基因的甲基化水平。

这一检测方案所选择的检测靶点由BLUEPRINT联盟所建议。BLUEPRINT联盟基于多平台多方法学开展一项大规模的研究项目,深入分析健康人和患者的基因激活或抑制差异,从而验证出癌症生物标志物。因此,这一检测方案是您靶向研究癌组织DNA甲基化水平的可靠方案。

? 检测用途:包含40个扩增子(内含2个对照),用于检测38个靶标的甲基化水平,这些靶点涵盖Bock文献中所涉及的与结肠癌,前列腺癌,白血病和淋巴瘤等癌种肿瘤标志物相关的靶标。(Bock, C. et al. Nature Biotechnology 34, 726–737 (2016))

? 优势:支持FFPE样本,低样本起始量(10 ng)即可检测DNA甲基化情况,灵敏度高,并配套数据解读方案

? 样品起始量:10-100 ng/样本

? 通量:16 samples/530 chip

? 数据解读:配套甲基化分析插件Methylation Analysis Plugin,用于分析每个扩增子甲基化和未甲基化的Reads数

? 适用范围:适用于肿瘤标志物的开发和研究,可用于肿瘤患者的样本,从而寻找肿瘤相关的特异性甲基化生物标志物

客户体验

David Berman, MD, PhD

加拿大皇后大学(Queen’s University)

癌症研究中心主任

 

· Ion AmpliSeq™ 甲基化检测法能帮助您解决哪些实验问题?

我们的实验室开发用于临床癌症诊断和管理的生物标记物。通过芯片法以及甲基化特异性PCR(MSP),我们已经在前列腺癌中鉴定了许多有利于诊断和预后DNA甲基化位点。我们发现它们单独都无法提供精确的诊断或临床信息,但结合起来,它们具有很大的应用前景。同时, MSP很难进行多位点检测,同时非常耗费人力。生物芯片法需要相对大量的输入DNA。因此,以上方法的限制使我们的研究会遗漏特别感兴趣的位点。重要的是,这些方法提供平均甲基化水平,这意味着在癌症中,良性细胞可以掩盖癌细胞特异性的异常甲基化。

· 为什么您选择Ion AmpliSeq™ 甲基化检测方案而不是其他方案?

AmpliSeq甲基化测序灵敏度高、准确度高,仅需10 ng的样本就能检测几十个靶点。除了能够实现多靶点检测和性能稳定外,赛默飞还开发了专属数据分析平台。这些都是我们选择这一产品的原因。

· Ion AmpliSeq™ 甲基化检测法和您以前用的方法相比如何?

该方法操作简单,并提升了报告流程、准确性、特异性、灵敏度和稳定性等方面的性能。

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如需订购和了解更多信息,欢迎大家登入。订购路径为:

? 登入—Made to Order panels—Pre-designed by our community—搜索“Methylation"

? 或通过此链接订购:

/panels/search.action?q=methylation&searchFacetValues=%22Panel+Type%22%2C%22COMMUNITY_PANEL%22&offset=0&pageLength=30&sortCriterion.fieldName=&sortCriterion.descFlag=

* 仅供研究使用,不用于诊断过程

点击https://www.wjx.top/jq/36168790.aspx马上填写Ion甲基化新品小问卷,提交问卷24小时获得新品详细资料,提出优质建议还有机会获得精美实用小风扇一台

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