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多年来，肿瘤专家根据每个患者肿瘤的DNA测序结果制定靶向治疗方案。而近年来，研究发现，通过RNA测序也能为提供有效的关键信息，且在一些关键基因检测上更具临床意义。目前，欧洲的一个研究小组的研究证实，DNA测序的同时进行RNA的测序可以帮助临床医生以更快的速度、更低的成本进行更准确的癌症诊断。

该研究项目覆盖3000例晚期NSCLC肿瘤患者

该回顾性研究是迄今为止同类研究中大的，自2014年7月到2018年4月，对3000例晚期非小细胞肺癌（NSCLC）患者进行了DNA和RNA水平的分析。

据海德堡大学医院（Heidelberg University Hospital）病理研究所分子病理学中心主任Albrecht Stenzinger博士介绍，与传统的单基因测试相比，高通量测序（NGS）所需的组织样本更少，速度更快，成本更低。Stenzinger博士主持了这项研究，该研究成果最近发表在国际癌症杂志中（International Journal of Cancer）。

DNA测序+RNA测序优势显著

Stenzinger博士与来自德国几家研究机构的多学科临床研究团队开展合作研究。研究结果表明，同时进行DNA和RNA靶向测序，并依据其结果进行肿瘤的诊断，在多方面都优于国际临床诊疗指南的推荐。他们在研究中所使用的检测和分析方法经过精心设计，有利于帮助肿瘤专家制定更多样化的治疗方案。

该团队研究方案是基于Ion AmpliSeq技术所设计的，针对实体肿瘤进行分析，利用Ion Torrent测序平台将周转时间平均缩短到6个工作日（国际指南目前推荐10个工作日）。当肿瘤组织量不足时，会存在一定的组织丢弃率；在实验优化过程中，该研究的组织丢弃率从6.5%下降到3.4%，平均所需样本量为10ng DNA和20ng RNA。

其研究目标是为尽可能多的患者获取合适的诊断信息，NGS尤其是基于Ampliseq技术的NGS，集多种优势，让研究者们更易于实现他们的目标。他们还强调了在常规临床环境中，应用该方法在病人护理和临床及转化研究中的个体化治疗有很好的可行性。

 

"RNA检测至关重要！"——Stenzinger博士

海德堡大学医院病理研究所分子病理学中心主任

Albrecht Stenzinger博士

Stenzinger博士说：

我们实验研究证明了这种一站式的检测方法，可以从少量的活检组织中同时提取DNA和RNA，然后对它们进行测序，使我们不仅有机会了解DNA水平上的突变，还可以了解转录水平的基因融合。

举个例子，我们不仅可以检测到一个肿瘤存在ALK基因的易位，也可以检测到因转录活跃而产生的ALK-ELM4融合。

虽然目前的指南建议通过荧光原位杂交实验（FISH）来进行RNA分析，但Stenzinger博士的研究表明，在NSCLC治疗中，一些已知的与预后和疗效预测密切相关的基因融合，如采用RNA测序检测，方法学上更优更好。基因融合发生于两条染色体上DNA片段的移位；然而，只有转录成RNA的融合体才有可能被表达并可能导致癌症。因此，该团队的研究成果可以帮助医生更有效地为患者确定积极的治疗和监测方案。

Stenzinger博士继续说道：

你能立刻知道病人在基因水平发生了什么问题，以及确定其基因微环境是否在疾病进展中起到了真正的作用。我们知道TP53突变会影响ALK阳性NSCLC患者的疗效和预后。举例来说，ALK基因融合某一变体会导致非常低的生存率。

当前，靶向治疗能有效提高NSCLC患者的生存期，但哪些人可能从这些新的治疗中受益，这取决于肿瘤组织中特定生物标志物的检测结果。

Stenzinger解释道：

对DNA和RNA同时进行测序，可以为临床医生提供更多信息用于治疗方案的选择和制定。
该研究仍在进行，在该研究队列中，预计每年将增加1000例样本。同时，目前的方法也可以调整并应用在其他研究中，包括肿瘤突变负荷的临床研究。

 

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