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北京百泰派克生物科技有限公司
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一文看懂多肽組學(xué)在癌癥檢測中的潛力

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一文看懂多肽組學(xué)在癌癥檢測中的潛力檢測技術(shù)服務(wù): 多肽組學(xué)(peptidomics)作為質(zhì)譜(mass spectrometry)驅(qū)動的生命科學(xué)分支,能全面分析體內(nèi)天然存在的短肽或多肽片段。這些片段往往攜帶疾病特異性信息,是癌癥早期診斷和療效監(jiān)測的新興生物標(biāo)志物來源。本文將從技術(shù)基礎(chǔ)、應(yīng)用前沿和發(fā)展趨勢三方面系統(tǒng)解析多肽組學(xué)在癌癥檢測中的潛力,并軟性植入 百泰派克生物科技 在該領(lǐng)域的優(yōu)勢能力。

一文看懂多肽組學(xué)在癌癥檢測中的潛力檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

多肽組學(xué)(peptidomics)作為質(zhì)譜(mass spectrometry)驅(qū)動的生命科學(xué)分支,能全面分析體內(nèi)天然存在的短肽或多肽片段。這些片段往往攜帶疾病特異性信息,是癌癥早期診斷和療效監(jiān)測的新興生物標(biāo)志物來源。本文將從技術(shù)基礎(chǔ)、應(yīng)用前沿和發(fā)展趨勢三方面系統(tǒng)解析多肽組學(xué)在癌癥檢測中的潛力,并軟性植入 百泰派克生物科技 在該領(lǐng)域的優(yōu)勢能力。


一、什么是多肽組學(xué)?

1、技術(shù)定位

。多肽組學(xué)研究的是未經(jīng)酶切的內(nèi)源短肽(約8–30?aa),與dànbáizhì組學(xué)(proteomics)相比,無需yídànbáiméi消化,能直接捕捉生理/病理生成的肽段


2、分離與檢測方法

。多肽組學(xué)通常采用液相色譜(LC)或基質(zhì)輔助雷射解吸/電離(MALDI-TOF-MS)進(jìn)行肽段分離和高分辨質(zhì)譜分析


3、數(shù)據(jù)處理與識別

。利用 MS/MS 數(shù)據(jù)庫對接,配合生物信息學(xué)算法(如 DDA/DIA、深度學(xué)習(xí)),實(shí)現(xiàn)多肽序列的定性定量鑒定


二、多肽組學(xué)在癌癥檢測中的主要應(yīng)用

1、早期癌癥篩查

(1)非小細(xì)胞肺癌(NSCLC): 血清多肽指紋圖譜有助于區(qū)分早期 NSCLC 與良性病變,以及健康對照。

(2)口腔癌預(yù)測: 通過口腔唾液或血清多肽組學(xué)發(fā)現(xiàn)與預(yù)后相關(guān)的候選多肽。


2、huàliáo療效與耐藥監(jiān)測

肺鱗癌人群: 利用 MALDI-TOF-MS 分析huàliáo敏感組與耐藥組的血清多肽差異,建立療效預(yù)測模型。


3、miǎnyìzhìliáo靶點(diǎn)探索

(1)免疫多肽組學(xué)(Immunopeptidomics): 分析腫瘤細(xì)胞通過 MHC-I/II 遞呈的突變多肽(neoantigens),揭示腫瘤“暗物質(zhì)",為個性化腫瘤疫苗與 T?細(xì)胞療法提供靶點(diǎn)。

(2)生物信息聯(lián)動: 結(jié)合 WES、RNA-seq、in silico MHC 配對和 MS 數(shù)據(jù),jīngzhǔn篩選具免疫原性的突變多肽。


4、抗腫瘤功能肽發(fā)現(xiàn)

。通過噬菌體展示、AI 篩選等策略,從毒液肽、天然生理肽庫中篩選具有腫瘤靶向或細(xì)胞毒性的功能多肽


三、優(yōu)勢與挑戰(zhàn)

1、相比傳統(tǒng)生物標(biāo)志物的優(yōu)勢

(1)高靈敏性:可檢測低豐度肽段,反應(yīng)早期病理變化。

(2)源于體內(nèi)生成:無需酶切處理,保留了生理狀態(tài)下的結(jié)構(gòu)和修飾。

(3)標(biāo)志物通用性強(qiáng):多肽指紋可適用于不同樣本來源,如血液、唾液、尿液。


2、當(dāng)前挑戰(zhàn)

(1)樣本處理標(biāo)準(zhǔn)化不足,易影響肽譜穩(wěn)定性和可重復(fù)性。

(2)高豐度肽遮蔽低豐度肽信號,需要豐富策略解決。

(3)臨床驗(yàn)證不夠深入,多數(shù)研究仍處于候選驗(yàn)證階段,缺少臨床試驗(yàn)支撐。

(4)免疫肽識別算法仍需改進(jìn),MS 數(shù)據(jù)量大,需更準(zhǔn)、更快的深度學(xué)習(xí)模型。


四、多肽組學(xué)典型流程

多肽組學(xué)的實(shí)驗(yàn)流程需高度jīngzhǔn與標(biāo)準(zhǔn)化,以確保分析結(jié)果的重復(fù)性和生物學(xué)意義。以下是從樣本采集到生物標(biāo)志物驗(yàn)證的標(biāo)準(zhǔn)操作流程:

1、樣本采集與預(yù)處理

(1)樣本類型:多肽可來源于多種生物基質(zhì),如血清、血漿、尿液、腦脊液(CSF)、唾液及組織勻漿。

(2)關(guān)鍵考量:避免蛋白降解、肽段失活和預(yù)分析變化是核心,例如使用蛋白酶抑制劑、防凍劑,并快速凍存于 ?80?°C。

(3)標(biāo)準(zhǔn)化策略:統(tǒng)一采樣時間點(diǎn)、處理溫度與離心條件,以減少組間變異性。


2、多肽提取與富集

(1)蛋白沉淀去除:使用三lǜyǐsuān(TCA)、乙腈/甲醇沉淀或熱處理快速去除高豐度大分子蛋白,釋放內(nèi)源多肽。

(2)固相萃?。⊿PE):C18 或強(qiáng)陽離子交換(SCX)柱常用于富集多肽,去除鹽類、小分子干擾物。

(3)高通量策略:自動化 SPE 平臺和磁珠富集技術(shù)提升處理效率并減少批間差異。


3、分離分析

(1)液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS/MS):以納升級 LC(nanoLC)結(jié)合高分辨率質(zhì)譜(如 Orbitrap、TOF)進(jìn)行肽段分離與檢測。

(2)MALDI-TOF-MS 分析:用于快速指紋分析與初篩,適合大樣本量、多組別研究。

(3)離子遷移譜(IMS)等新興技術(shù):進(jìn)一步提升肽段結(jié)構(gòu)識別能力,分辨異構(gòu)肽。


4、數(shù)據(jù)采集與定性定量

(1)數(shù)據(jù)采集模式:


  • DDA(Data-Dependent Acquisition):常用于探索性研究,捕捉信號zuì強(qiáng)的肽段進(jìn)行 MS/MS。

  • DIA(Data-Independent Acquisition):全譜段掃描,適合大樣本、穩(wěn)定性分析。


(2)定量方式:


  • 標(biāo)簽法(TMT/iTRAQ)用于多組比較。

  • 無標(biāo)記法(Label-Free)適合大規(guī)模隊(duì)列,簡化操作。

  • 靶向法(MRM/PRM)用于生物標(biāo)志物驗(yàn)證。


5、生物信息學(xué)分析

(1)多肽識別:使用數(shù)據(jù)庫搜索引擎(如 Mascot、PEAKS、MaxQuant)結(jié)合深度學(xué)習(xí)模型輔助序列匹配。

(2)差異分析:結(jié)合統(tǒng)計學(xué)方法(如 t 檢驗(yàn)、ANOVA)和多變量分析(如 PCA、PLS-DA),挖掘具有顯著差異的候選肽段。

(3)功能注釋與通路富集:對差異多肽進(jìn)行 KEGG/GO 富集分析,揭示其潛在生物學(xué)功能。

(4)肽段溯源:將鑒定肽段追溯到上游蛋白及剪切機(jī)制,探索病理狀態(tài)下的蛋白水解調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。


6、生物標(biāo)志物驗(yàn)證與臨床轉(zhuǎn)化

(1)靶向定量驗(yàn)證:通過 MRM/PRM 質(zhì)譜平臺,驗(yàn)證候選肽在獨(dú)立隊(duì)列中的表達(dá)趨勢。

(2)免疫學(xué)方法融合:若開發(fā)抗體成功,可結(jié)合 ELISA、Western Blot 等手段進(jìn)行臨床可轉(zhuǎn)化驗(yàn)證。

(3)模型構(gòu)建:通過機(jī)器學(xué)習(xí)(如 SVM、XGBoost)整合多個標(biāo)志物,建立預(yù)測模型并評估其敏感性、特異性(AUC、ROC 分析)。




百泰派克生物科技在“多肽組學(xué)+癌癥檢測"領(lǐng)域,具備以下優(yōu)勢:

1、gāoduān質(zhì)譜平臺:采用 Orbitrap Fusion Lumos、Q?EQ96 等高分辨儀器,具備高通量電離能力。

2、zhuānyè技術(shù)團(tuán)隊(duì):SCI 出版及臨床項(xiàng)目背景團(tuán)隊(duì),熟練 LC-MS/MS、MALDI 和免疫多肽組學(xué)方法。

3、標(biāo)準(zhǔn)化流程與質(zhì)量控制:從采樣、提取、檢測到數(shù)據(jù)管理,均可根據(jù)客戶需求設(shè)計并滿足 GLP/GCLP 標(biāo)準(zhǔn)。

4、定制開發(fā)能力強(qiáng):支持多肽指紋庫構(gòu)建、突變肽篩選與功能性驗(yàn)證。

5、賦能客戶落地轉(zhuǎn)化:結(jié)合 MRM/PRM/ELISA 平臺,助力體外診斷試劑和臨床驗(yàn)證的快速推進(jìn)。


多肽組學(xué)是癌癥檢測中的科研前沿,具備高靈敏、結(jié)構(gòu)保真、疾病特異性強(qiáng)的優(yōu)勢,正逐步走向臨床應(yīng)用。隨著免疫多肽組學(xué)與人工智能技術(shù)進(jìn)步,多肽生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)與驗(yàn)證將更高效、更jīngzhǔn。百泰派克生物科技憑借*質(zhì)譜平臺和zhuānyè研發(fā)能力,可為客戶提供“一站式"多肽組學(xué)服務(wù),助力腫瘤標(biāo)志物研究與體外診斷開發(fā)。如果您關(guān)注多肽組學(xué)在癌癥檢測的落地應(yīng)用,歡迎聯(lián)系我們,共同探索jīngzhǔn醫(yī)學(xué)的未來。


百泰派克生物科技特色項(xiàng)目


一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進(jìn)行分析。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。



三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.技術(shù)*,*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭?xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時進(jìn)行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。



百泰派克生物科技七大檢測平臺

一文看懂多肽組學(xué)在癌癥檢測中的潛力




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);

2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;

5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!



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