無標(biāo)記定量肽組學(xué)：探索樣本中肽的真實(shí)表達(dá)量檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

“無biāojìdìng量肽組學(xué)"（Label-Free Quantitative Peptidomics, LFQ）是一種利用質(zhì)譜技術(shù)進(jìn)行dànbáizhì/肽段定量的方法，通過該方法能有效探索樣本中肽的真實(shí)表達(dá)量，具有無需引入同位素或化學(xué)標(biāo)簽的優(yōu)勢，適用于高通量、低成本、多樣本的生物學(xué)研究，它通過測量肽段在質(zhì)譜中的信號(hào)強(qiáng)度或譜圖數(shù)量，間接推算其在樣本中的相對豐度的定量方法。不同于 SILAC、TMT 等標(biāo)簽技術(shù)，LFQ 不依賴任何外源標(biāo)記，適用于更廣泛的樣本類型和研究場景。標(biāo)簽方法（如 SILAC、TMT、iTRAQ）雖廣受歡迎，但成本高、實(shí)驗(yàn)流程復(fù)雜。相比之下，“無biāojìdìng量肽組學(xué)"以其無需化學(xué)標(biāo)簽、成本更低、操作更靈活的優(yōu)勢，越來越多地被科研團(tuán)隊(duì)和生物醫(yī)藥企業(yè)采用。

一、無biāojìdìng量肽組學(xué)的主流定量方法

1、基于離子強(qiáng)度（Intensity?Based LFQ）

利用 MS1 峰面積（Area Under the Curve, AUC）或峰強(qiáng)度與肽濃度呈線性相關(guān)性進(jìn)行定量。依托高分辨質(zhì)譜（如 Orbitrap、FT?ICR），可覆蓋 2?3 個(gè)數(shù)量級(jí)的動(dòng)態(tài)范圍，非常適合檢測低豐度蛋白。

2、基于譜圖計(jì)數(shù)（Spectral?Counting）

統(tǒng)計(jì) MS2 的觸發(fā)次數(shù)，認(rèn)為捕獲次數(shù)與蛋白豐度成正比。方法直觀易實(shí)現(xiàn)，但對低豐度肽靈敏度相對較低，線性范圍較窄。

近年來，“數(shù)據(jù)獨(dú)立采集（DIA）"技術(shù)融合強(qiáng)度和譜圖數(shù)據(jù)優(yōu)勢，實(shí)現(xiàn)高覆蓋、低漏檢的無biāojìdìng量，成為行業(yè)趨勢。

二、無biāojìdìng量肽組學(xué)技術(shù)流程詳解

1、樣本制備

從組織、細(xì)胞或生物液體（血清、尿液等）中提取dànbáizhì，經(jīng)yídànbáiméi酶解生成肽段。LFQ 跳過化學(xué)標(biāo)簽步驟，流程更簡潔，通用性更強(qiáng)。

2、LC?MS/MS 分析

（1）使用高性能液相色譜分離肽段

（2）采用 DDA 或 DIA 模式采集 MS 數(shù)據(jù)

（3）DIA 模式下，采集覆蓋所有 m/z 區(qū)間，可極大提高定量覆蓋度和重現(xiàn)性

3、定量處理

（1）結(jié)合zhuānyè軟件（如 MaxQuant、OpenMS、Proteome Discoverer），完成峰提取、保留時(shí)間對齊與強(qiáng)度標(biāo)準(zhǔn)化

（2）通過對照樣本、內(nèi)標(biāo)或歸一化方法修正技術(shù)誤差

4、差異統(tǒng)計(jì)分析

（1）實(shí)施 t?檢驗(yàn)、ANOVA、多重假設(shè)校正

（2）構(gòu)建 Volcano 圖、熱圖等可視化結(jié)果，引導(dǎo)下游生物學(xué)解讀

5、生物驗(yàn)證階段

核心肽段或差異蛋白進(jìn)一步使用 PRM（Parallel Reaction Monitoring）、WB（Western Blot）、ELISA 等手段驗(yàn)證，增強(qiáng)結(jié)果可信度。

三、無biāojìdìng量肽組學(xué)優(yōu)勢一覽

1、高通量、jíjù靈活性：無需標(biāo)簽合成，批次少，適合進(jìn)行大樣本、高重復(fù)實(shí)驗(yàn)。

2、顯著成本優(yōu)勢：省去昂貴的同位素試劑，實(shí)驗(yàn)成本下降約?30–50%，適合科研或企業(yè)預(yù)算受限情況。

3、動(dòng)態(tài)范圍寬3 個(gè)數(shù)量級(jí)：zhuóyuè的檢測潛力適合探索復(fù)雜樣本中的低豐度肽。

4、實(shí)驗(yàn)隨需增樣：自由擴(kuò)充樣本量，頻繁用于探索性研究、臨床隊(duì)列、藥效篩檢等場景。

5、兼容多種樣本類型：適用于 FFPE、血清、組織、細(xì)胞系等多種生物樣本，無“標(biāo)簽兼容"困擾。

四、挑戰(zhàn)與局限

1、批次重現(xiàn)性問題：各批次實(shí)驗(yàn)獨(dú)立，儀器漂移增加變異，需通過內(nèi)標(biāo)或批次校正策略控制噪聲。

2、低豐度肽敏感性不足：在復(fù)雜背景中弱信號(hào)可能難以被 MS 探測，需優(yōu)化 LC 梯度與質(zhì)譜參數(shù)。

3、數(shù)據(jù)處理繁重：高通量產(chǎn)出 PB 級(jí)數(shù)據(jù)，缺失值*、對齊和濾除冗余流程復(fù)雜。

4、定量精度略遜于標(biāo)簽法：與 SILAC、TMT 等方法相比，無標(biāo)記 LFQ 有時(shí)精度略低，但工具和算法正在縮小這一差距。

五、應(yīng)用場景：科研實(shí)踐與產(chǎn)業(yè)落地

1、生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)

通過 LFQ 對比疾病 vs 健康樣本，篩選潛在生物標(biāo)志物（oncoproteins、炎癥指標(biāo)等），再結(jié)合 PRM 驗(yàn)證以提高可信度。

2、藥物作用機(jī)制研究

藥物處理后細(xì)胞或動(dòng)物模型中定量對比蛋白表達(dá)變化，解析信號(hào)通路和機(jī)制預(yù)測。

3、質(zhì)量控制與批次一致性監(jiān)測

制藥領(lǐng)域用于疫苗、重組蛋白生產(chǎn)中宿主蛋白（HCP）監(jiān)控，保障生物制品安全性和穩(wěn)定性。

4、環(huán)境與代謝應(yīng)答研究

用于植物、微生物、動(dòng)物模型在外界應(yīng)激、藥物、化合物干預(yù)后的蛋白組響應(yīng)監(jiān)測，助力代謝機(jī)制解析。

六、新興趨勢與前沿突破

1、nDIA（窄帶寬 DIA）技術(shù)：兼顧覆蓋深度與采樣速度，可實(shí)現(xiàn) 15–30 分鐘 LC 梯度高通量分析。

2、DirectLFQ 等高階歸一化算法：通過自動(dòng)化歸一化、大規(guī)模批次標(biāo)準(zhǔn)校正，提高信號(hào)精度。

3、單細(xì)胞蛋白組 LFQ：借助 nano-LC 與高靈敏 MS，逐步拓展至單細(xì)胞層面的表達(dá)測序。

4、標(biāo)準(zhǔn)化社區(qū)推動(dòng)：如 HUPO-PSI 標(biāo)準(zhǔn)格式（mzML、mzTab）促進(jìn)數(shù)據(jù)互通與公開共享。

作為 LFQ 領(lǐng)域先鋒，百泰派克生物科技 致力于提供一站式高質(zhì)量無biāojìdìng量肽組學(xué)解決方案，隨著 DIA、DirectLFQ 以及社區(qū)標(biāo)準(zhǔn)化進(jìn)展，LFQ 的精度與重現(xiàn)性將持續(xù)提升。百泰派克生物科技擁有人才、設(shè)備和經(jīng)驗(yàn)優(yōu)勢，能為科研團(tuán)隊(duì)和產(chǎn)業(yè)用戶提供高質(zhì)量、可信賴、可量化的肽組定量服務(wù)，攜手邁向定量組學(xué)新時(shí)代。如果您正從事生物標(biāo)志物開發(fā)、藥物機(jī)制研究或疫苗/生物制品質(zhì)量監(jiān)控，歡迎聯(lián)系百泰派克生物科技，獲取zhuānyè LFQ 定量肽組學(xué)支持——zhuānyè分析，科技驅(qū)動(dòng)，加速科研突破。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭?xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

無標(biāo)記定量肽組學(xué)：探索樣本中肽的真實(shí)表達(dá)量檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹