ABPP如何補足表達組學(xué)的功能盲區(qū)？檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在多組學(xué)數(shù)據(jù)日益豐富的jīntiān，表達組學(xué)（Transcriptomics） 依舊是揭示基因調(diào)控機制的主力手段之一。通過RNA-Seq等技術(shù)，研究者可以全面掌握基因在不同條件下的轉(zhuǎn)錄表達情況。然而，這種“表達即功能"的邏輯推演，正面臨一個難以回避的盲區(qū)：轉(zhuǎn)錄水平的變化并不等于蛋白的活性狀態(tài)發(fā)生了變化。而這正是活性位點導(dǎo)向dànbáizhì譜技術(shù)（Activity-Based Protein Profiling, ABPP） 所擅長的領(lǐng)域。ABPP（Activity-Based Protein Profiling，基于活性的小分子探針蛋白zhìzǔxué）是一種研究dànbáizhì功能狀態(tài)的強大化學(xué)蛋白zhìzǔxué技術(shù)。它能夠有效補足表達組學(xué)（如轉(zhuǎn)錄組、傳統(tǒng)dànbáizhì組）存在的“功能盲區(qū)"。ABPP如何補足表達組學(xué)的功能盲區(qū)？剖析ABPP技術(shù)如何補足表達組學(xué)的不足，并介紹其在藥物發(fā)現(xiàn)、疾病標(biāo)志物篩選等方面的應(yīng)用潛力是當(dāng)今科研人員面臨的重要課題。

一、表達組學(xué)的“功能盲區(qū)"是什么？

1、表達組學(xué)（如轉(zhuǎn)錄組和傳統(tǒng)dànbáizhì組）通常測量的是：

（1）mRNA水平（轉(zhuǎn)錄組）：反映基因的轉(zhuǎn)錄活性，但無法說明蛋白是否翻譯、是否活躍

（2）蛋白水平（dànbáizhì組）：反映蛋白的表達豐度，但不能判斷其酶活性或功能狀態(tài)

2、因此，它們存在以下盲區(qū)：

（1）無法區(qū)分活性與非活性蛋白（如失活酶、變構(gòu)調(diào)節(jié)等）

（2）忽略dànbáizhì翻譯后修飾（PTMs）帶來的功能變化

（3）無法反映蛋白功能狀態(tài)的動態(tài)調(diào)控（如底物結(jié)合、酶-抑制劑相互作用）

（4）對于低豐度但高功能活性的蛋白不敏感

這些問題共同構(gòu)成了一個關(guān)鍵盲點——我們知道某個基因被表達了，卻無法確認它是否“在工作"。要想真正理解細胞在生理或病理狀態(tài)下的功能變化，需要超越表達，走向“活性"。

二、ABPP的基本原理

ABPP是一種基于小分子探針的質(zhì)譜技術(shù)，專門用于篩選和標(biāo)注活性狀態(tài)下的dànbáizhì亞群。

1、其基本原理是：

（1）利用具有高選擇性的反應(yīng)性探針，共價修飾活性中心

（2）通過標(biāo)記富集，將目標(biāo)蛋白從復(fù)雜背景中“釣"出來

（3）借助高分辨率LC-MS/MS對其進行識別和定量

與蛋白zhìzǔxué相比，ABPPzuì大的優(yōu)勢在于其選擇性標(biāo)記活躍dànbáizhì，而非所有表達的蛋白。這使得它可以直接捕捉功能狀態(tài)的變化，而不僅僅是數(shù)量上的浮動。

三、ABPP探針通常包含

（1）反應(yīng)基團：共價結(jié)合酶活性位點

（2）報告基團：用于富集、熒光成像或質(zhì)譜分析

（3）連接臂：將反應(yīng)基團與報告基團連接

探針僅與活性形式的蛋白結(jié)合

（1）因此能夠選擇性捕捉功能性蛋白

（2）區(qū)分不同功能狀態(tài)的同一蛋白

（3）監(jiān)測動態(tài)變化（如藥物作用、病理狀態(tài)）

四、ABPP如何補足表達組學(xué)？

1、 彌合表達與功能的鴻溝

通過在轉(zhuǎn)錄組學(xué)之后增加ABPP層面的驗證，研究者可以快速確認哪些基因的表達變化真正轉(zhuǎn)化為蛋白功能的改變，大幅提高候選靶點的生物學(xué)可信度。

2、 揭示隱藏的調(diào)控通路

ABPP特別適合分析代謝酶、蛋白酶、磷酸酶等酶類蛋白的活性狀態(tài)，在細胞信號傳導(dǎo)、免疫應(yīng)答等領(lǐng)域jíjù優(yōu)勢，能夠補足表達組學(xué)在通路分析上的空白。

3. 增強多組學(xué)整合價值

在整合轉(zhuǎn)錄組、蛋白組和代謝組時，ABPP作為功能層面的錨點，可增強組學(xué)之間的生物學(xué)聯(lián)動解釋力，推動真正意義上的系統(tǒng)生物學(xué)分析。

五、實際應(yīng)用場景

1、腫瘤研究：發(fā)現(xiàn)活躍的致癌酶、代謝通路

2、藥物靶點發(fā)現(xiàn)：識別真實靶點 vs 離靶效應(yīng)

3、免疫學(xué)：研究活性酶在炎癥反應(yīng)中的作用

4、微生物生態(tài)：捕捉功能相關(guān)蛋白而非僅依賴序列注釋

5、疾病早期診斷標(biāo)志物開發(fā)：通過活性變化尋找生物標(biāo)志物

ABPP實驗的成功并不只取決于儀器靈敏度，更高度依賴于探針設(shè)計的合理性與樣品處理流程的嚴謹性。百泰派克生物科技結(jié)合多年質(zhì)譜平臺經(jīng)驗，打造了從探針篩選、樣本富集、活性標(biāo)記、定量分析到生物信息學(xué)解讀的全流程ABPP服務(wù)。我們具備：高通量Orbitrap質(zhì)譜平臺，確?；钚缘鞍椎膉īngzhǔn識別與定量；完善的生物信息分析流程，支持與轉(zhuǎn)錄組、蛋白組等數(shù)據(jù)，配合我們自研的樣品前處理流程與QC控制體系，即使是復(fù)雜組織或臨床樣本也能保證數(shù)據(jù)一致性與可重復(fù)性。我們將幫助科研人員快速定位關(guān)鍵靶標(biāo)，并提出具有機制假說價值的研究方向。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白zhìzǔxué

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白zhìzǔxué分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)*，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標(biāo)同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

ABPP如何補足表達組學(xué)的功能盲區(qū)？檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹