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當(dāng)前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測技術(shù)服務(wù)>>蛋白分析>> 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析的五大常用方法及應(yīng)用場景
產(chǎn)品型號(hào)
品 牌百泰派克
廠商性質(zhì)其他
所 在 地北京市
更新時(shí)間:2025-06-22 09:35:02瀏覽次數(shù):73次
聯(lián)系我時(shí),請告知來自 化工儀器網(wǎng)Bottom-Up 蛋白質(zhì)組學(xué)如何實(shí)現(xiàn)精
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dànbáizhì的功能與其三維結(jié)構(gòu)密切相關(guān),結(jié)構(gòu)信息不僅有助于解釋其生物學(xué)行為,還廣泛應(yīng)用于藥物設(shè)計(jì)、抗體工程、代謝通路解析等多個(gè)研究方向。當(dāng)前,研究者可選擇多種技術(shù)手段對dànbáizhì結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,每種方法側(cè)重點(diǎn)不同,適用于不同類型的dànbáizhì與研究目標(biāo)。
一、X射線晶體衍射(X-ray Crystallography)
??方法簡介
X射線晶體衍射是高分辨率的結(jié)構(gòu)解析方法,通過測量dànbáizhì晶體對X射線的衍射圖樣,構(gòu)建其電子密度圖并還原原子排布。該技術(shù)可實(shí)現(xiàn)0.8?以下的原子級(jí)精度。
??應(yīng)用場景
高分辨率結(jié)構(gòu)建模:適用于構(gòu)建單體蛋白或復(fù)合物的jīngquè三維模型。
靶向藥物設(shè)計(jì):支持結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上的小分子篩選與優(yōu)化。
功能機(jī)制研究:有助于揭示酶催化位點(diǎn)、活性中心構(gòu)型等關(guān)鍵結(jié)構(gòu)細(xì)節(jié)。
??注意事項(xiàng)
對晶體質(zhì)量要求jígāo,部分dànbáizhì(如膜蛋白、大型復(fù)合物)難以結(jié)晶。
二、冷凍電鏡(Cryo-Electron Microscopy, Cryo-EM)
??方法簡介
冷凍電鏡以電子束代替光源,直接對快速冷凍后的dànbáizhì顆粒進(jìn)行成像與三維重構(gòu)。無需結(jié)晶、樣品需求量少,是結(jié)構(gòu)生物學(xué)中快速崛起的重要手段。
??應(yīng)用場景
大型復(fù)合物結(jié)構(gòu)解析:適合核糖體、病毒顆粒等高分子量體系。
膜蛋白研究:解決晶體衍射難以應(yīng)對的膜類蛋白結(jié)構(gòu)問題。
多構(gòu)象狀態(tài)分析:可觀察dànbáizhì在不同功能狀態(tài)下的形態(tài)變化。
??注意事項(xiàng)
對樣品均一性、數(shù)據(jù)采集與圖像處理能力要求高,適合有一定基礎(chǔ)的研究團(tuán)隊(duì)。
三、核磁共振波譜(Nuclear Magnetic Resonance, NMR)
??方法簡介
NMR利用核自旋在磁場中的共振行為分析原子之間的距離與連接方式,在溶液狀態(tài)下重建dànbáizhì的三維結(jié)構(gòu),尤其適合研究dànbáizhì的動(dòng)態(tài)變化。
??應(yīng)用場景
小分子蛋白結(jié)構(gòu)解析:適合分子量在30kDa以下的dànbáizhì。
dànbáizhì動(dòng)態(tài)行為研究:可捕捉構(gòu)象交換、柔性結(jié)構(gòu)域及內(nèi)在無序區(qū)域。
dànbáizhì-配體相互作用監(jiān)測:揭示結(jié)合位點(diǎn)及結(jié)合后的構(gòu)象響應(yīng)。
??注意事項(xiàng)
解析效率隨分子量上升迅速下降,對設(shè)備和樣品制備要求較高。
四、交聯(lián)-質(zhì)譜(Cross-Linking Mass Spectrometry, XL-MS)
??方法簡介
XL-MS通過化學(xué)交聯(lián)劑固定dànbáizhì中相鄰氨基酸殘基,然后用質(zhì)譜技術(shù)檢測交聯(lián)肽段,推測其空間近距離關(guān)系,從而對整體構(gòu)象做出結(jié)構(gòu)約束。
??應(yīng)用場景
粗粒度構(gòu)象模型構(gòu)建:為三維建模提供距離限制信息。
dànbáizhì互作分析:識(shí)別dànbáizhì間或蛋白內(nèi)部的關(guān)鍵接觸區(qū)域。
驗(yàn)證其他結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù):常用于補(bǔ)充Cryo-EM、XRD的結(jié)構(gòu)模型。
??注意事項(xiàng)
分辨率較低,通常用于輔助研究或高通量篩查,不可獨(dú)立作為主結(jié)構(gòu)模型依據(jù)。
五、氫氘交換質(zhì)譜(Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry, HDX-MS)
??方法簡介
HDX-MS基于氨基酸骨架氫原子與氘水中氘的交換反應(yīng),監(jiān)測dànbáizhì不同區(qū)域的溶劑暴露程度和構(gòu)象穩(wěn)定性,反映其動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)信息。
??應(yīng)用場景
構(gòu)象變化追蹤:適合研究dànbáizhì活化、折疊、穩(wěn)定性變化等現(xiàn)象。
抗原-抗體結(jié)合位點(diǎn)映射:廣泛用于抗體工程和生物藥開發(fā)。
dànbáizhì工程優(yōu)化:識(shí)別柔性區(qū)域,輔助設(shè)計(jì)更穩(wěn)定構(gòu)型。
??注意事項(xiàng)
實(shí)驗(yàn)敏感度高,數(shù)據(jù)處理依賴質(zhì)譜解析能力和軟件算法支持。
六、方法選擇建議
不同結(jié)構(gòu)分析技術(shù)在分辨率、動(dòng)態(tài)信息、樣品適應(yīng)性與通量方面各有側(cè)重,通常應(yīng)根據(jù)具體科研問題組合使用:
隨著生物醫(yī)藥、合成生物學(xué)等領(lǐng)域?qū)ànbáizhì結(jié)構(gòu)信息需求的提升,科研人員正面臨樣品復(fù)雜、目標(biāo)多樣、周期緊張等多重挑戰(zhàn)。選擇適當(dāng)?shù)慕Y(jié)構(gòu)解析方法,并進(jìn)行高質(zhì)量的樣品處理與數(shù)據(jù)解讀,是確保科研成功的關(guān)鍵。百泰派克生物科技立足蛋白組學(xué)與質(zhì)譜技術(shù),結(jié)合結(jié)構(gòu)生物學(xué)的應(yīng)用需求,提供dànbáizhì結(jié)構(gòu)鑒定服務(wù)。我們致力于與科研人員共同推進(jìn)dànbáizhì結(jié)構(gòu)功能研究,助力原始創(chuàng)新與技術(shù)轉(zhuǎn)化。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進(jìn)行分析。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實(shí)現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;
2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;
3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.技術(shù)優(yōu)良,填補(bǔ)技術(shù)空白
采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭?xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征,百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測51個(gè)目標(biāo)蛋白。
2.分析數(shù)量大,成本較低
單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。
3.應(yīng)用前景大
①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。
百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計(jì)量/期間核查,軟件審計(jì)追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊和生產(chǎn)放行。
1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);
2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);
3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;
4.七大質(zhì)量控制檢測平臺(tái),滿足您一站式服務(wù)需求;
5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!
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