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當(dāng)前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測(cè)技術(shù)服務(wù)>>蛋白分析>> 如何利用CD分析蛋白質(zhì)熱穩(wěn)定性
產(chǎn)品型號(hào)
品 牌百泰派克
廠商性質(zhì)其他
所 在 地北京市
更新時(shí)間:2025-06-19 11:33:57瀏覽次數(shù):59次
聯(lián)系我時(shí),請(qǐng)告知來自 化工儀器網(wǎng)如何用Top-Down蛋白質(zhì)組學(xué)分析糖蛋
Top-Down蛋白質(zhì)組學(xué)在腫瘤標(biāo)志物發(fā)
Bottom-Up 蛋白質(zhì)組學(xué)分析流程全
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dànbáizhì熱穩(wěn)定性是衡量其結(jié)構(gòu)完整性與功能保持能力的關(guān)鍵指標(biāo),廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、蛋白工程和生物藥開發(fā)等多個(gè)領(lǐng)域。圓二色譜(Circular Dichroism, CD)是一種敏感、快速且低樣本量的光譜技術(shù),常用于分析dànbáizhì二級(jí)結(jié)構(gòu)的構(gòu)象變化,特別適合評(píng)估熱變性行為和熔點(diǎn)(Tm)等熱穩(wěn)定性參數(shù)。
一、CD技術(shù)在dànbáizhì熱穩(wěn)定性分析中的作用
圓二色譜是依賴手性分子對(duì)左右旋圓偏振光吸收差異的光譜技術(shù)。對(duì)于dànbáizhì而言,其二級(jí)結(jié)構(gòu)(如α-螺旋、β-折疊)會(huì)在190–250nm的遠(yuǎn)紫外區(qū)域產(chǎn)生特征性CD信號(hào)。例如,α-螺旋通常在208nm與222nm附近顯示雙重負(fù)峰,而β-折疊結(jié)構(gòu)在216nm左右表現(xiàn)為負(fù)峰。當(dāng)溫度升高導(dǎo)致dànbáizhì發(fā)生熱變性時(shí),其原有的有序結(jié)構(gòu)被破壞,CD光譜的特征信號(hào)會(huì)發(fā)生顯著變化。因此,通過監(jiān)測(cè)不同溫度下蛋白的CD信號(hào),尤其是222nm處橢圓率值的變化,可jīngquè描繪蛋白熱解構(gòu)過程,進(jìn)一步計(jì)算熔點(diǎn)Tm值,反映其熱穩(wěn)定性。
二、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)與操作關(guān)鍵點(diǎn)
為獲得可靠的CD熱變性數(shù)據(jù),實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)需要充分考慮樣品特性、緩沖體系、波長(zhǎng)選擇與升溫條件等多重因素。
1、蛋白樣品制備
樣品純度和均一性對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果至關(guān)重要。推薦使用純度>90%的dànbáizhì,避免聚集體或多態(tài)性干擾。緩沖液應(yīng)具備良好的熱穩(wěn)定性和低紫外吸收,常用如PBS、HEPES等,避免使用Tris等溫度敏感緩沖液。蛋白濃度一般控制在0.1–0.5mg/mL,確保獲得良好的信噪比。
2、波長(zhǎng)選擇
熱變性實(shí)驗(yàn)通常選擇222nm作為主要監(jiān)測(cè)波長(zhǎng),因其對(duì)α-螺旋結(jié)構(gòu)變化zuì敏感。對(duì)β-折疊結(jié)構(gòu)豐富的蛋白,也可關(guān)注216nm波長(zhǎng)處的變化。完整的遠(yuǎn)紫外CD光譜(190–250nm)可用于變性前后結(jié)構(gòu)比較,輔助判斷變性過程的方向與程度。
3、溫度范圍與升溫速率
溫度通常從10°C起,逐漸升高至90–95°C,具體依據(jù)dànbáizhì的預(yù)期穩(wěn)定性設(shè)定。升溫速率建議控制在0.5–1°C/min,保證系統(tǒng)熱平衡,避免數(shù)據(jù)偏差。每隔1–2°C記錄一個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn),可描繪出平滑的溫度-橢圓率曲線。
4、可逆性測(cè)試
在部分研究場(chǎng)景中,評(píng)估蛋白變性過程是否可逆具有重要意義??稍谕瓿缮郎貟呙韬?,將樣品緩慢冷卻至初始溫度,再重新采集CD光譜,與加熱前光譜比較。若結(jié)構(gòu)能夠恢復(fù),說明變性過程具有一定可逆性,適用于構(gòu)象可恢復(fù)的天然蛋白或某些工程蛋白設(shè)計(jì)的評(píng)價(jià)。
三、數(shù)據(jù)解讀與Tm計(jì)算方法
CD熱變性實(shí)驗(yàn)的結(jié)果通常表現(xiàn)為典型的S型曲線:初始階段蛋白結(jié)構(gòu)穩(wěn)定,橢圓率信號(hào)保持恒定;隨著溫度升高,蛋白逐步解構(gòu),橢圓率急劇下降;zuì終趨于平臺(tái),代表wánquán變性狀態(tài)。
Tm值提取
Tm值是熱穩(wěn)定性分析的核心參數(shù),表示dànbáizhì失去一半有序結(jié)構(gòu)的溫度。常采用雙態(tài)轉(zhuǎn)變模型(two-state transition model)對(duì)熱變性曲線進(jìn)行非線性擬合,假設(shè)蛋白在“天然態(tài)"與“變性態(tài)"之間直接轉(zhuǎn)化。通過擬合可準(zhǔn)確獲得Tm值及協(xié)同性參數(shù),量化熱變性過程。對(duì)于多結(jié)構(gòu)域或多穩(wěn)定態(tài)蛋白,變性過程可能涉及多個(gè)Tm,需根據(jù)曲線形態(tài)與波峰/拐點(diǎn)位置綜合判斷,或輔以多波長(zhǎng)分析提高解析能力。
四、實(shí)驗(yàn)中常見問題及優(yōu)化建議
1、信號(hào)波動(dòng)或曲線不連續(xù)
可能由緩沖液干擾、蛋白聚集或氣泡引起。應(yīng)確保緩沖液經(jīng)脫氣處理、使用匹配的石英比色皿,并在樣品制備后短時(shí)間內(nèi)完成實(shí)驗(yàn)。
2、Tm值重復(fù)性差
需檢查升溫系統(tǒng)穩(wěn)定性、樣品是否降解或緩沖系統(tǒng)是否失效。建議每個(gè)樣品重復(fù)測(cè)試至少3次,確認(rèn)Tm值具有統(tǒng)計(jì)意義。
3、解構(gòu)不wánquán或無明顯轉(zhuǎn)變
可能是dànbáizhì極度穩(wěn)定,Tm超出檢測(cè)上限;也可能蛋白本身構(gòu)象柔性高,熱誘導(dǎo)不顯著。此時(shí)可嘗試延長(zhǎng)升溫范圍、調(diào)節(jié)緩沖環(huán)境,或考慮聯(lián)合化學(xué)變性策略如尿素誘導(dǎo)。
圓二色譜技術(shù)作為dànbáizhì熱穩(wěn)定性研究的重要工具,因其對(duì)二級(jí)結(jié)構(gòu)敏感、操作簡(jiǎn)便、樣品消耗低等特點(diǎn),已廣泛應(yīng)用于天然dànbáizhì、重組蛋白及突變體構(gòu)象穩(wěn)定性的評(píng)估。通過優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件與數(shù)據(jù)分析方法,科研人員可快速、jīngzhǔn地獲取Tm等關(guān)鍵參數(shù),從而為dànbáizhì功能機(jī)制解析、工程優(yōu)化與藥物研發(fā)提供強(qiáng)有力的數(shù)據(jù)支持。在CD分析及蛋白穩(wěn)定性研究領(lǐng)域,百泰派克生物科技憑借先進(jìn)的儀器平臺(tái)和規(guī)范化實(shí)驗(yàn)流程,致力于為科研人員提供高質(zhì)量的dànbáizhì圓二色譜分析服務(wù),助力您揭示蛋白構(gòu)象背后的生物學(xué)意義。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù),包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù),對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。
※服務(wù)優(yōu)勢(shì):
1.采用目前世界上先進(jìn)的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;
4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測(cè);
6.測(cè)序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。
※服務(wù)優(yōu)勢(shì):
1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;
2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;
3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;
4.可檢測(cè)較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。
※服務(wù)優(yōu)勢(shì):
1.技術(shù)先進(jìn),填補(bǔ)技術(shù)空白
采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征,百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。
2.分析數(shù)量大,成本較低
單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。
3.應(yīng)用前景大
①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。
百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計(jì)量/期間核查,軟件審計(jì)追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。
1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù);
2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);
3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;
4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái),滿足您一站式服務(wù)需求;
5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!
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