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當前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測技術(shù)服務(wù)>>蛋白分析>> 什么是DIA與SWATH?一文了解數(shù)據(jù)非
產(chǎn)品型號
品 牌百泰派克
廠商性質(zhì)其他
所 在 地北京市
更新時間:2025-06-14 10:35:05瀏覽次數(shù):71次
聯(lián)系我時,請告知來自 化工儀器網(wǎng)如何用Top-Down蛋白質(zhì)組學(xué)分析糖蛋
Top-Down蛋白質(zhì)組學(xué)在腫瘤標志物發(fā)
Bottom-Up 蛋白質(zhì)組學(xué)分析流程全
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質(zhì)譜技術(shù)是現(xiàn)代dànbáizhì組學(xué)研究的核心工具,而采集策略的不同,決定了實驗數(shù)據(jù)的覆蓋率、重復(fù)性和定量精度。近年來,數(shù)據(jù)非依賴采集技術(shù)(Data-Independent Acquisition, DIA)迅速崛起,并逐漸成為取代數(shù)據(jù)依賴采集(Data-Dependent Acquisition, DDA)的主流趨勢。在DIA技術(shù)體系中,zuì具代表性的實現(xiàn)方式便是SWATH-MS(Sequential Window Acquisition of All Theoretical Fragment Ion Spectra)。本文將帶你系統(tǒng)了解DIA與SWATH的原理、區(qū)別、優(yōu)勢及其在科研和臨床研究中的典型應(yīng)用。
一、什么是DIA?
DIA(Data-Independent Acquisition)是一類質(zhì)譜采集策略,其核心特點是不依賴母離子強度實時選擇碎裂目標,而是系統(tǒng)性地對全部m/z范圍進行分段采集。相比DDA策略中只碎裂zuì強信號的前若干個母離子(TopN),DIA更接近于一種“全量掃描"模式,能同時獲取更全面、重復(fù)性更強的MS/MS數(shù)據(jù)。
? DIA的優(yōu)勢在于:
無偏采集,覆蓋更全:不漏掉低豐度蛋白;
采集邏輯固定,重復(fù)性強:適合大規(guī)模樣本分析;
全譜保存,可反復(fù)挖掘:數(shù)據(jù)生命周期更長。
二、什么是SWATH?
SWATH-MS是DIA技術(shù)中zuì早被標準化實現(xiàn)和商業(yè)推廣的版本。它的設(shè)計理念是:將質(zhì)譜的掃描范圍(如400–1200 m/z)劃分為多個等寬或變寬的窗口(例如25 Da),并對每個窗口中的所有母離子進行同步碎裂,然后記錄所有碎片離子信息。
? SWATH的dútè優(yōu)勢包括:
采集窗口連續(xù)覆蓋,無盲區(qū);
平臺成熟,算法完善(如OpenSWATH、PeakView、Spectronaut);
適用于血漿、腫瘤等高復(fù)雜樣本類型;
已被廣泛用于臨床轉(zhuǎn)化研究和多中心大隊列研究。
三、DIA與SWATH的關(guān)系與區(qū)別
四、DIA/SWATH的技術(shù)優(yōu)勢
1、全譜采集,不遺漏任何信號
無論是DIA的library-free方案,還是SWATH的窗口分段采集,均實現(xiàn)了對所有母離子的全面覆蓋,顯著提升低豐度蛋白的檢測能力。
2、高重復(fù)性,適合大規(guī)模研究
預(yù)設(shè)掃描策略避免了DDA隨機采集帶來的數(shù)據(jù)波動,確保跨樣本、跨批次的數(shù)據(jù)一致性,尤其適合多中心、長期隊列研究。
3、可重復(fù)挖掘,數(shù)據(jù)價值zuì大化
由于碎片數(shù)據(jù)已被全量記錄,DIA/SWATH采集的數(shù)據(jù)可支持后期重新分析,不必重復(fù)上機,大幅提升數(shù)據(jù)利用率和研究效率。
五、典型應(yīng)用場景
1、腫瘤蛋白組學(xué)
SWATH技術(shù)在腫瘤組織樣本中表現(xiàn)出優(yōu)異的定量穩(wěn)定性與組間可比性,助力發(fā)現(xiàn)與驗證腫瘤生物標志物。
2、藥物作用機制研究
DIA全譜掃描能力可系統(tǒng)捕捉蛋白表達變化,幫助還原藥物干預(yù)下的信號通路動態(tài),為新藥研發(fā)提供強有力支持。
3、臨床復(fù)雜樣本高通量分析
如血漿、腦脊液等樣本背景復(fù)雜,SWATH平臺的數(shù)據(jù)一致性和抗干擾能力顯著優(yōu)于DDA,適合構(gòu)建高可靠性臨床蛋白組學(xué)數(shù)據(jù)庫。
4、多中心大隊列研究
SWATH-MS因其采集方式固定,特別適合在不同儀器和不同批次之間進行數(shù)據(jù)對齊與對比,已廣泛用于大型多機構(gòu)合作項目。
DIA技術(shù)正推動dànbáizhì組學(xué)進入一個“全面、高通量、可重復(fù)"的新時代。而SWATH作為其zuì成熟的實現(xiàn)路徑,為科研人員提供了穩(wěn)定、可靠、低門檻的進入方式。百泰派克生物科技融合優(yōu)良質(zhì)譜平臺與多維算法,提供高質(zhì)量的SWATH定量蛋白組學(xué)服務(wù)。無論您是初涉DIA的新用戶,還是尋求更高數(shù)據(jù)質(zhì)量的研究團隊,百泰派克生物科技都將是您可信賴的合作伙伴。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進行分析。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;
2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復(fù)度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.技術(shù)優(yōu)良,*技術(shù)空白
采用金屬標記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數(shù)量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應(yīng)用前景大
①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。
1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);
3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;
4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;
5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!
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