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當前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測技術(shù)服務(wù)>>多組學整合分析>> 16S/18S/ITS擴增子測序
產(chǎn)品型號
品 牌百泰派克
廠商性質(zhì)其他
所 在 地北京市
更新時間:2025-06-04 14:02:55瀏覽次數(shù):98次
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擴增子測序是對特定長度的PCR產(chǎn)物或者捕獲的片段進行測序,目前主要是應(yīng)用高通量測序技術(shù)對特定環(huán)境中特定遺傳物質(zhì)進行測序。大多數(shù)天然微生物都不能通過傳統(tǒng)的分離培養(yǎng)方法進行分離和克隆,這對于天然微生物定性和定量,探索微生物多樣性是嚴重的挑戰(zhàn)。擴增子測序可以克服傳統(tǒng)分離培養(yǎng)的弱點,對樣品中的微生物進行定性和定量,目前在微生物多樣性檢測中廣泛應(yīng)用。 16S和18S rDNA是細菌和真菌中16s或18s rDNA基因的高變區(qū),而ITS(Internal Transcribed Spacer)則是細菌、真菌和古細菌中小亞基和大亞基rRNA基因之間的間隔區(qū)DNA。這些特定的遺傳物質(zhì)都包括進化保守性及進化可變區(qū)。由于PCR擴增容易,可以從少量DNA中擴增出來,而基因序列即使在近緣種間也有高度的變異,因而擴增子測序在分類學和分子系統(tǒng)學中得到了廣泛的應(yīng)用。 根據(jù)研究目的不同擴增子測序可細分為如下幾個產(chǎn)品類型: 16S rDNA測序:16S rDNA是編碼16S rRNA的基因,存在于所有細菌基因組。16S rDNA既能體現(xiàn)不同菌屬之間的差異,又能利用測序技術(shù)較容易地得到其序列,目前被廣泛用于病原菌的檢測和鑒定。16S rRNA的可變區(qū)經(jīng)常用于不同微生物群落的屬或種系統(tǒng)進化分類。 18S rDNA測序:18S rDNA為編碼真核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列。在結(jié)構(gòu)上分為保守區(qū)和高變區(qū),保守區(qū)反映生物物種間的親緣關(guān)系,高變區(qū)反映物種間的差異,18S rDNA在進化速率上相對于ITS更加保守。
ITS測序:在真核生物中,18S rDNA和28S rDNA轉(zhuǎn)錄間隔序列稱為ITS區(qū)。ITS由于是非轉(zhuǎn)錄區(qū),承受的選擇壓力較小,變異強。ITS屬于中度保守區(qū)域,利用它可研究種及種以下的分類階元。
擴增子測序技術(shù)優(yōu)勢: 鑒定效率高:與克隆或培養(yǎng)等傳統(tǒng)鑒定方法相比,微生物群16S/18S/ITS測序是一種更快、更準確的方法; 雙區(qū)檢測:針對一個或多個可變區(qū)域的靈活性,能夠進行更長的序列讀取,并能夠?qū)溥M行更準確的分析; 較低的成本:與宏基因組測序相比,對測序深度的要求更低,性價比較高; 高靈敏度:可以鑒定出豐度極低的細菌。
擴增子測序?qū)嶒灹鞒蹋?
擴增子測序分析流程:
擴增子測序服務(wù)優(yōu)勢: 經(jīng)驗豐富的技術(shù)人員,可以提供從實驗設(shè)計、樣品檢測、數(shù)據(jù)分析等全套zhuānyè服務(wù); 流程明確,減少不必要的樣品和時間浪費,交付時間短; 不同來源樣本采用不同提取方法和建庫測序策略,滿足多種環(huán)境研究需求; 百泰派克生物科技擁有蛋白組、代謝組等分析平臺,可進行多組學整合分析,提升文章質(zhì)量。 擴增子測序樣品要求: 樣品類型:Meta樣品,如糞便、土壤等或Meta DNA樣品均可進行檢測。具體要求請咨詢技術(shù)人員。
擴增子測序案例展示:
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進行分析。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務(wù),助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;
2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統(tǒng)準確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.技術(shù)優(yōu)良,*技術(shù)空白
采用金屬標記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數(shù)量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應(yīng)用前景大
①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。
1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);
3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等;
4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;
5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!
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