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北京百泰派克生物科技有限公司
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什么是De Novo測序?檢測技術(shù)服務(wù)

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品       牌百泰派克

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更新時間:2025-06-04 13:09:34瀏覽次數(shù):120次

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什么是De Novo測序?檢測技術(shù)服務(wù): De Novo測序是指在沒有任何已知序列信息或參考數(shù)據(jù)庫的情況下,通過實驗數(shù)據(jù)直接推斷出一段生物分子(如DNA、RNA、dànbáizhì)的原始一級結(jié)構(gòu)的技術(shù)。它是研究全新物種、新突變體、未知抗體、天然蛋白等生物樣本時的關(guān)鍵方法。在dànbáizhì組學(xué)領(lǐng)域,De Novo測序是利用高分辨率質(zhì)譜(MS/MS)對酶解后的多肽片段進(jìn)行碎片離子分析,通過軟件算

什么是De Novo測序?檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

De Novo測序是指在沒有任何已知序列信息或參考數(shù)據(jù)庫的情況下,通過實驗數(shù)據(jù)直接推斷出一段生物分子(如DNA、RNA、dànbáizhì)的原始一級結(jié)構(gòu)的技術(shù)。它是研究全新物種、新突變體、未知抗體、天然蛋白等生物樣本時的關(guān)鍵方法。在dànbáizhì組學(xué)領(lǐng)域,De Novo測序是利用高分辨率質(zhì)譜(MS/MS)對酶解后的多肽片段進(jìn)行碎片離子分析,通過軟件算法解析離子峰圖譜,從而逐個推斷氨基酸序列,再拼接出完整蛋白序列的過程。與傳統(tǒng)依賴數(shù)據(jù)庫比對的方法不同,De Novo測序是真正的結(jié)構(gòu)推斷技術(shù),能發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)庫中不存在的新蛋白、突變形式或翻譯后修飾。


一、De Novo測序與數(shù)據(jù)庫測序有何不同?


什么是De Novo測序?檢測技術(shù)服務(wù)


二、De Novo測序的應(yīng)用價值

De Novo測序不再只是前沿實驗室的探索性技術(shù),而正在成為抗體藥物研發(fā)、非模式物種研究、生物信息挖掘和生物制藥質(zhì)量控制中的剛性需求。

1、抗體結(jié)構(gòu)重建與表達(dá)模板設(shè)計

抗體是當(dāng)前zuì重要的治療性蛋白藥物之一,但在實際應(yīng)用中,科研人員和企業(yè)手中常常只有抗體的蛋白樣品,卻無法獲得其原始基因序列或來源細(xì)胞。在這種情況下,De Novo測序技術(shù)可直接對抗體蛋白進(jìn)行酶解與質(zhì)譜分析,還原出重鏈與輕鏈的完整氨基酸序列,特別是CDR區(qū)域,進(jìn)而可用于后續(xù)cDNA反向設(shè)計、表達(dá)系統(tǒng)構(gòu)建及功能驗證。這項技術(shù)正在幫助科研人員復(fù)現(xiàn)老抗體、開發(fā)生物類似藥、優(yōu)化親和力突變設(shè)計等,顯著提升抗體工程效率。


2、疫苗誘導(dǎo)抗體譜圖分析與臨床免疫研究

在疫苗開發(fā)和免疫評估中,研究者越來越關(guān)注疫苗誘導(dǎo)產(chǎn)生的多克隆抗體是否具備高親和性和中和能力。傳統(tǒng)BCR測序無法反映抗體翻譯后修飾與真實構(gòu)象,而De Novo測序可以直接對血清或組織液中的抗體蛋白進(jìn)行結(jié)構(gòu)解析,捕捉其真實表達(dá)形式與修飾狀態(tài),實現(xiàn)抗體克隆譜圖的重建與功能富集。特別是在腫瘤疫苗、HIV、中和抗體研發(fā)等領(lǐng)域,這項技術(shù)正成為理解免疫反應(yīng)的關(guān)鍵工具。


3、非模式生物和未知物種蛋白解析

在植物、微生物、海洋生物、中藥活性成分等非模式生物研究中,dànbáizhì組數(shù)據(jù)庫普遍存在缺失或注釋不全的情況。De Novo測序無需參考基因組或已知蛋白序列,適用于新物種、新組織、新狀態(tài)下的dànbáizhì表達(dá)探索。例如:在研究中藥成分中蛋白類活性物質(zhì)時,De Novo測序可直接從提取物中識別出生物活性蛋白,從而推進(jìn)天然藥物開發(fā)。


4、生物藥一致性驗證與質(zhì)量控制

在生物藥生產(chǎn)過程中,不同批次、不同表達(dá)系統(tǒng)(如CHO與HEK293)可能會引入微小的結(jié)構(gòu)差異,甚至改變翻譯后修飾模式。De Novo測序能夠?qū)崿F(xiàn)對表達(dá)產(chǎn)物的全長結(jié)構(gòu)還原與比對,不僅能識別顯著突變,還能標(biāo)注糖基化、氧化、異構(gòu)體等微觀修飾,有效支持藥品一致性評估、仿制藥開發(fā)及申報材料撰寫。


5、癌癥新抗原(Neoantigen)發(fā)現(xiàn)與個性化miǎnyìzhìliáo

癌細(xì)胞中常常會產(chǎn)生dútè的突變肽段,即“新抗原"。這些Neoantigen是當(dāng)前癌癥疫苗、T細(xì)胞治療的核心靶標(biāo)。傳統(tǒng)蛋白組分析方式常因序列突變與修飾錯過這些低豐度新肽段,而De Novo測序可以識別數(shù)據(jù)庫中從未注釋的、僅在病灶表達(dá)的新肽段,配合免疫原性預(yù)測工具,為個體化治療提供jīngzhǔn標(biāo)靶。


6、蛋白修飾圖譜構(gòu)建與結(jié)構(gòu)功能關(guān)聯(lián)研究

許多蛋白的生物學(xué)功能受其翻譯后修飾調(diào)控(如糖基化、乙?;?、磷酸化等)。De Novo測序不僅能還原蛋白本體序列,還能在高分辨質(zhì)譜數(shù)據(jù)中同步解析修飾類型、修飾位點和修飾占比。這為探索蛋白功能狀態(tài)、構(gòu)象變化、相互作用機(jī)制提供了可靠數(shù)據(jù)支撐,是結(jié)構(gòu)生物學(xué)、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)研究等方向的重要工具。


百泰派克生物科技的De Novo測序服務(wù)

在百泰派克,我們?yōu)榭贵w研究、蛋白藥研發(fā)、疾病機(jī)制研究等提供高精度、高覆蓋、高復(fù)現(xiàn)性的De Novo測序解決方案。技術(shù)特色包括:

* 多酶消化 + 高分辨質(zhì)譜(Orbitrap Fusion Lumos)


  • 自研De Novo拼接算法 + 人工復(fù)核機(jī)制

  • 支持修飾識別、CDR覆蓋、序列建模與表達(dá)驗證

  • 適用于抗體、融合蛋白、重組酶、突變蛋白等多種類型


無論您是科研人員還是生物醫(yī)藥從業(yè)者,只需提供抗體或蛋白樣本,我們可在3~4周內(nèi)為您還原出可重組、可表達(dá)、可用于zhuānlì設(shè)計的完整結(jié)構(gòu)信息。在信息高度依賴數(shù)據(jù)庫的jīntiān,De Novo測序代表著另一種能力——不依賴他人、從零開始、解讀未知。它不是替代數(shù)據(jù)庫方法,而是在面對全新課題、復(fù)雜樣本、未知抗體時,zuì可靠、zuì靈活、zuì具探索性的策略。百泰派克生物科技將持續(xù)以zhuānyè的實驗平臺與計算能力,幫助更多客戶走出數(shù)據(jù)庫的“舒適區(qū)",走進(jìn)蛋白結(jié)構(gòu)的“真實世界"。


百泰派克生物科技特色項目


一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進(jìn)行分析。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。



三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.技術(shù)優(yōu)良,*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭?xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時進(jìn)行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。



百泰派克生物科技七大檢測平臺

什么是De Novo測序?檢測技術(shù)服務(wù)




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);

2.獲國家CNAS實驗室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;

5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!



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