什么是靶向定量蛋白質組學？檢測技術服務詳情介紹

“靶向定量dànbáizhì組學"（Targeted Quantitative Proteomics）是一種高靈敏度、高特異性的dànbáizhì組分析策略，廣泛應用于生物標志物驗證、疾病機制研究、藥效學評估和質量控制等領域。相比發(fā)現(xiàn)型（Discovery）dànbáizhì組學，靶向定量強調對特定目標蛋白進行jīngzhǔn、重復性強的定量分析。

本文將從基本原理、主流技術平臺、實驗流程到典型應用，系統(tǒng)梳理靶向定量dànbáizhì組學的核心內容，幫助研究人員科學選擇合適的技術方案。

一、什么是靶向定量dànbáizhì組學？

靶向定量dànbáizhì組學以預選的蛋白或肽段為對象，通過設定特定的離子轉移通道或全產(chǎn)物離子掃描策略，獲取目標的定量信息。其特點包括：

1、明確靶點（目標蛋白或肽段）

2、使用標準品或內標進行定量校正

3、重復性強，適合臨床與大樣本研究

4、檢測靈敏度遠高于發(fā)現(xiàn)型蛋白組

二、主流技術平臺

1、MRM/SRM（Multiple/Selected Reaction Monitoring）

（1）儀器平臺：三重四極桿質譜（Triple Quadrupole）

（2）原理：選擇特定前體離子 → 誘導斷裂 → 檢測特定產(chǎn)物離子

（3）特點：

* 高通量、低背景干擾

• 適合數(shù)十~數(shù)百個靶點的定量

• 與代謝組學中MRM思路一致

2、PRM（Parallel Reaction Monitoring）

（1）儀器平臺：高分辨率質譜（如Orbitrap、Q-TOF）；

（2）原理：選擇前體離子 → 同時記錄所有產(chǎn)物離子

（3）特點：

* jīngzhǔn度更高，特異性更強

• 適合復雜背景中的靶點識別

• 可應用于驗證階段或臨床樣本

3、DIA-based靶向方法

（1）趨勢：整合高分辨DIA（Data-independent acquisition）技術，通過內標引導實現(xiàn)高效靶向分析

（2）優(yōu)勢：

* 提高多肽覆蓋度

• 適合多樣本高通量定量

三、靶向定量dànbáizhì組與發(fā)現(xiàn)型蛋白組的對比

四、靶向定量dànbáizhì組學實驗流程概覽

1、靶點篩選與肽段設計

* 來源于前期DIA分析、文獻報道、數(shù)據(jù)庫（如PeptideAtlas）

• 篩選穩(wěn)定、特異、離子化效率好的肽段作為定量單位

2、標準品合成（可選）

合成穩(wěn)定同位素標記肽（SIS）用于juéduì定量

3、樣本前處理

蛋白提取 → 酶解 → 凈化 → 加入內標

4、質譜分析

根據(jù)項目選擇MRM或PRM

5、數(shù)據(jù)處理與定量分析

Skyline、SkyQuant、Scaffold DIA等zhuānyè軟件

五、靶向定量dànbáizhì組學的應用場景

1、生物標志物驗證

在腫瘤、自身免疫病、感染性疾病等研究中，MRM/PRM常用于驗證前期篩選出的候選蛋白，支持轉化醫(yī)學研究。

2、藥效學與毒理學評估

監(jiān)測藥物干預前后特定蛋白的表達變化，評價藥物靶點、作用通路是否被調控。

3、合成生物學與蛋白表達優(yōu)化

在細胞工廠構建過程中，對關鍵酶蛋白的表達水平進行定量，優(yōu)化表達效率。

4、質量控制與批間一致性檢測

在生物制品生產(chǎn)（如抗體、重組蛋白）中監(jiān)測特定雜質蛋白或功能位點表達。

在靶向定量dànbáizhì組學領域，百泰派克生物科技整合高靈敏三重四極桿質譜平臺與高分辨Orbitrap平臺，可提供包括MRM、PRM、內標定量在內的多種服務形式：

* 個性化靶點設計服務：支持文獻挖掘、DIA數(shù)據(jù)整合、靶點篩選

• 高質量穩(wěn)定同位素標記肽定制

• 標準化數(shù)據(jù)處理流程，保證結果一致性與可比性

• 支持從發(fā)現(xiàn)型蛋白組到靶向驗證的全流程服務

靶向定量dànbáizhì組學是從“廣撒網(wǎng)"到“jīngzhǔn打擊"的關鍵一步，它在疾病機制研究、臨床轉化和生物制藥中的價值不斷提升。通過選擇合適的技術平臺（MRM或PRM）和優(yōu)化實驗設計，科研人員可以實現(xiàn)對目標蛋白的靈敏、穩(wěn)定和可重復檢測。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，N端測序，C端測序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統(tǒng)進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數(shù)據(jù)轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術優(yōu)良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優(yōu)質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質的生物質譜分析服務!

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