蛋白質(zhì)相互作用質(zhì)譜分析檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在過(guò)去的幾十年中，以質(zhì)譜(MS)為基礎(chǔ)的蛋白質(zhì)組學(xué)已經(jīng)成為鑒定蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用分析(PPIs)的重要技術(shù)。蛋白質(zhì)通過(guò)與其它蛋白質(zhì)或化合物相互作用，形成大分子化合物，從而發(fā)揮生物學(xué)功能。對(duì)蛋白質(zhì)相互作用的研究能夠幫助我們更好的理解蛋白質(zhì)。當(dāng)通過(guò)IP, CO IP或GST pull-down等蛋白質(zhì)相互作用分析手段，獲得靶標(biāo)蛋白后，通過(guò)質(zhì)譜分析方法對(duì)該蛋白進(jìn)行分析，鑒定及定量，能夠?qū)ο嗷プ饔玫鞍走M(jìn)行表征，進(jìn)一步對(duì)蛋白質(zhì)功能進(jìn)行分析。親和純化結(jié)合質(zhì)譜分析（Affinity purification combined with mass spectrometry, AP-MS）則允許在特定生理?xiàng)l件下無(wú)偏差的對(duì)相互作用蛋白進(jìn)行檢測(cè)。一種做法是利用SILAC方法分別標(biāo)記實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組細(xì)胞后進(jìn)行Co-IP實(shí)驗(yàn)，依靠抗原與抗體之間的專一性反應(yīng)分離得到免疫復(fù)合物；再通過(guò)LC-MS/MS來(lái)定性/定量檢測(cè)免疫復(fù)合物中的蛋白；當(dāng)實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組中某個(gè)蛋白質(zhì)的含量達(dá)到統(tǒng)計(jì)學(xué)差異時(shí)，判定這個(gè)蛋白質(zhì)與研究的蛋白具有相互作用，可極大降低蛋白質(zhì)互作假陽(yáng)性結(jié)果可能性。SILAC技術(shù)和Co-IP-MS技術(shù)結(jié)合可用于高通量定量分析在特定情況下蛋白的互作蛋白網(wǎng)。

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對(duì)Pull-down實(shí)驗(yàn)捕獲到的細(xì)胞中相互作用較低、豐度低的靶蛋白進(jìn)行質(zhì)譜鑒定： 用于高通量定量分析在特定生理?xiàng)l件下蛋白的互作蛋白網(wǎng)絡(luò)分析：免疫共沉淀法（CO-IP）結(jié)合質(zhì)譜聯(lián)用的蛋白互作分析

GST融合蛋白Pull-down技術(shù)結(jié)合質(zhì)譜聯(lián)用的蛋白互作分析

SILAC與免疫共沉淀結(jié)合質(zhì)譜聯(lián)用的蛋白互作分析

蛋白質(zhì)相互作用質(zhì)譜分析

質(zhì)譜鑒定相互作用蛋白的兩個(gè)常用方法是肽指紋圖譜分析法（peptide fingerprinting）和niǎoqiāng法蛋白質(zhì)組學(xué)分析法（shot-gun proteomics）。肽指紋圖譜分析法，通過(guò)SDS-PAGE，對(duì)蛋白樣品進(jìn)行分離。聚丙烯酰胺凝膠可以是考馬斯亮藍(lán)（coomassie）和銀染條帶。但是需要樣品條帶是單一條帶，即只含有一個(gè)蛋白條帶。將切下來(lái)的蛋白條帶用酶進(jìn)行消化后，通過(guò)質(zhì)譜進(jìn)行分析。這些消化后得到的肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析后，通過(guò)與理論數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)的方式，生物信息學(xué)分析拼接得到目的蛋白的信息。肽指紋圖譜法的一些局限性在于，該方法需要在切膠過(guò)程中得到單一的蛋白條帶，如果有雜帶將會(huì)影響檢測(cè)的準(zhǔn)確性，因?yàn)殡s帶中的蛋白信息可能會(huì)掩蓋真實(shí)的目的蛋白的信息。因此比較適用于較純的蛋白樣品的鑒定。而niǎoqiāng法蛋白質(zhì)組學(xué)分析法的強(qiáng)大之處在于，niǎoqiāng法可以對(duì)蛋白混合物進(jìn)行分析。 niǎoqiāng法蛋白質(zhì)組學(xué)的原理是先將蛋白質(zhì)樣品消化成肽段，然后將肽段通過(guò)高效液相色譜(HPLC)法進(jìn)行分離。分離后的肽段直接進(jìn)入質(zhì)譜儀進(jìn)行分析。質(zhì)譜分析包括了兩個(gè)過(guò)程，一級(jí)質(zhì)譜（MS1）及二級(jí)質(zhì)譜（MS2）。一級(jí)質(zhì)譜獲取高效液相色譜MS1中洗脫的肽的質(zhì)量-電荷比（m/z）和肽的強(qiáng)度（intensity）；二級(jí)質(zhì)譜通過(guò)對(duì)肽段氨基酸序列進(jìn)行確定，MS2選擇單個(gè)肽段對(duì)其進(jìn)行萃裂從而得到該肽段的光譜數(shù)據(jù)。檢索軟件根據(jù)二級(jí)質(zhì)譜信息與相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)，結(jié)合匹配度打分及錯(cuò)配過(guò)濾，可得到肽段的確切序列，進(jìn)而拼接出各蛋白的完整序列，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白的鑒定。 百泰派克生物科技既可以為您蛋白相互作用分析實(shí)驗(yàn)后的蛋白樣品進(jìn)行檢測(cè)，也可以您寄來(lái)樣品，百泰派克生物科技提供一站式互作蛋白檢測(cè)，包括蛋白互作實(shí)驗(yàn)，IP, CO IP, GST pull-down到蛋白樣品質(zhì)譜分析一站式完成。您只需要將您的需求和樣品寄給我們，我們會(huì)負(fù)責(zé)項(xiàng)目后續(xù)所有事宜，包括樣品前處理、蛋白互作實(shí)驗(yàn)、質(zhì)譜分析、質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)分析。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)蛋白質(zhì)序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)蛋白質(zhì)的氨基酸組成分析，N端測(cè)序，C端測(cè)序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白質(zhì)N端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的蛋白質(zhì)，提供基于從頭測(cè)序法的蛋白質(zhì)從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白質(zhì)組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白質(zhì)組學(xué)、靶向蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種蛋白質(zhì)標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從蛋白質(zhì)、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

蛋白質(zhì)相互作用質(zhì)譜分析檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹