医疗行业在安装在成套消毒设备洁净室的传动窗上，以及灭菌柜、洁净服的消毒均可采用医疗行业水消毒设备臭氧发生器。

1.安装在净化空调系统的净化空调系统臭氧发生器的安装位置上；
目前主要有三种类型：总回风管路，总送风管路和空调机组中。因该臭氧发生器体积小，且净化空调器的功能段较多，并配有许多中间检修段，故可将其安装在中间段内，并对臭氧发生器使用，仅要求由净化空调器产生的臭氧和伴随的热量能迅速全部进入到人循环空气中，因此可在净化空调器中串联安装。此外，在空调组装式臭氧发生器也方便安装和维护。若空调机单元的功能段较少，臭氧发生器不能安装在机组内部，则可安装在回风主管中。

2.臭氧发生器安装在(壁挂或移动式)一个房间中，这种安装方式的臭氧发生器型号较小，可以定期或连续对一个房间进行消毒灭菌；另外也可以采用移动方式，方便灵活。
3.医疗行业水消毒设备臭氧发生器安装在成套消毒设备洁净室的传动窗上，以及灭菌柜、洁净服的消毒均可采用臭氧发生器。这些设备中安装有臭氧发生器，根据需要将其打开，用于对物料的消毒。臭氧消毒灭菌时间，可根据GMP要求的洁净室数量和物料的菌落数量确认，确认后检查菌落数量，然后设定定时开启即可。