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梯度PCR儀常見問題的主要解決方案分享

閱讀:1819      發(fā)布時(shí)間:2022-9-26
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   梯度PCR儀是一臺(tái)小巧、可靠且經(jīng)濟(jì)的多孔PCR儀,非常適合小型實(shí)驗(yàn)室。有高分辨率超大彩色液晶顯示屏,實(shí)驗(yàn)過程中實(shí)時(shí)顯示溫控及運(yùn)行狀態(tài)。用戶可設(shè)置休眠模式使其更節(jié)電。
  梯度PCR儀常見問題的主要解決方案:
  1.梯度PCR儀在產(chǎn)物序列中引入了錯(cuò)誤
  這是由于聚合酶忠實(shí)性低或者循環(huán)數(shù)太多,這時(shí)需要使用帶有校正活性的熱穩(wěn)定聚合酶,同時(shí)降低循環(huán)數(shù)。此外,四種dNTP的濃度不同也會(huì)出現(xiàn)該問題,此時(shí)應(yīng)制備新的濃度相同的dNTP混合物。
  2.PCR跑膠
  該現(xiàn)象表現(xiàn)為目的條帶很亮,但是邊沿不清楚,前后有拖尾現(xiàn)象。出現(xiàn)這樣的問題,則需要進(jìn)行細(xì)致的分析,因?yàn)橐鹪搯栴}的可能很多。可先檢查是否模板質(zhì)量問題,如有降解等,模板應(yīng)避免反復(fù)凍融。也有可能是抽提RNA時(shí)有污染,則需要重新抽提RNA。此外,也可能是非特異性擴(kuò)增引發(fā)該問題,可提高退火溫度,少循環(huán)次數(shù)。電泳緩沖液時(shí)間太長,ph值和鹽離子濃度明顯改變、電泳時(shí)電壓太高、電泳液過久沒換,電泳膠臟了等都可能引發(fā)該問題。如果不是由上述原因引起,則進(jìn)一步檢查加樣量是否過大,制膠過程中膠孔是否制好,EB是否沖洗干凈、模板中是否混有基因組DNA或蛋白等。也需考慮是否擴(kuò)增的條件不合適。針對(duì)具體原因再采取相應(yīng)的措施。
  3.對(duì)梯度PCR儀產(chǎn)物需要用凝膠純化的時(shí)間掌控
  當(dāng)凝膠分析擴(kuò)增產(chǎn)物只有一條帶時(shí),則無需使用凝膠純化;
  當(dāng)可見其他雜帶時(shí),則可能是積累了大量引物的二聚體,在克隆前需要做凝膠純化。

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