引自10x Genomics的亞細(xì)胞空間原位表達(dá)分析技術(shù)（Xenium），通過已有/定制探針panel與靶點(diǎn)，在新鮮冷凍（FF）組織或福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）組織切片上快速檢測大量靶點(diǎn)的組織原位轉(zhuǎn)錄本表達(dá)水平，實(shí)現(xiàn)亞細(xì)胞分辨率對(duì)基因進(jìn)行靶向空間原位分析，揭示細(xì)胞結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系。

 一、技術(shù)流程及原理

首先在Xenium載玻片上制備FF或FFPE組織切片（每塊載玻片上的可成像區(qū)域?yàn)?2mm x24mm）。然后對(duì)切片進(jìn)行處理，RNA能更好的與可環(huán)化的DNA探針進(jìn)行雜交。雜交探針連接后產(chǎn)生可酶促擴(kuò)增的環(huán)狀DNA探針。之后將載玻片放入Xenium分析儀中，樣本在其中經(jīng)過連續(xù)幾輪的熒光探針雜交、成像和去除，產(chǎn)生明亮、易于成像且高信噪比的信號(hào)。接著生成每個(gè)基因特異性的熒光特征條碼，實(shí)現(xiàn)目標(biāo)基因的定位和識(shí)別。最后構(gòu)建出整張組織切片上亞細(xì)胞水平的空間原位圖譜。

 二、技術(shù)特點(diǎn)與優(yōu)勢

1、亞細(xì)胞分辨率

原位顯微成像的檢測方法，保留RNA分子的原位特征，亞細(xì)胞分辨率水平還原組織中細(xì)胞最真實(shí)的大小和邊界區(qū)分，實(shí)現(xiàn)“真"細(xì)胞-細(xì)胞通訊、受體-配體互作的可視化研究。

2、兼容多樣本類型

兼容新鮮冷凍組織（FF）和福爾馬林固定石蠟包埋組織（FFPE）樣品，滿足臨床及科研樣本的檢測分析需求。

3、高靈敏性和特異性

平均每個(gè)基因設(shè)計(jì)8對(duì)探針，根據(jù)表達(dá)量高低調(diào)整探針數(shù)量；du特的配對(duì)捕獲探針設(shè)計(jì)，增強(qiáng)了檢測的靈敏性和特異性。

4、panel組合靈活定制

panel基礎(chǔ)上，可靈活定制多至100個(gè)靶標(biāo)基因，更兼容全定制服務(wù)，增強(qiáng)了臨床和科學(xué)研究的創(chuàng)新性，同時(shí)可根據(jù)普通轉(zhuǎn)錄組RNA-seq以及單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)scRNA-seq實(shí)驗(yàn)中已獲取的數(shù)據(jù)，定制高達(dá)300個(gè)靶點(diǎn)的個(gè)性化研究策略，助力轉(zhuǎn)化研究和空間水平挖掘。

5、全景“無gap"掃描及玻片再利用

成像區(qū)域（12 x 24 mm）內(nèi)開展超高重靶點(diǎn)的組織全景無gap掃描，Xenium實(shí)驗(yàn)后仍可繼續(xù)利用同一玻片做其他實(shí)驗(yàn)，可高效充分地利用珍貴的臨床樣本。

6、強(qiáng)大的數(shù)據(jù)綜合分析及深度挖掘能力

wan全標(biāo)準(zhǔn)化的集成生物信息學(xué)分析流程，經(jīng)驗(yàn)豐富的多組學(xué)數(shù)據(jù)分析團(tuán)隊(duì)，能夠?qū)ι飳W(xué)數(shù)據(jù)及臨床數(shù)據(jù)進(jìn)行綜合分析及深度挖掘，使得數(shù)據(jù)挖掘更加便捷化、個(gè)性化。

 三、技術(shù)服務(wù)內(nèi)容

目前guan方已經(jīng)推出panel包括：人乳腺 280 個(gè)基因、人腦 266 個(gè)基因、人肺 289 個(gè)基因、人皮膚282個(gè)基因、人結(jié)腸322個(gè)基因、人腫瘤免疫380個(gè)基因、人類多種組織癌癥組織377個(gè)基因、小鼠腦 247 個(gè)基因和小鼠組織圖譜379個(gè)基因，以上panel均可增加 1~100 定制化基因。應(yīng)用場景仍在不斷拓展，未來會(huì)有更多組織類型的商品化 Panel，應(yīng)用于腫瘤、發(fā)育等不同領(lǐng)域的探索。