存在问题近红外光谱分析技术现阶段已相对成熟，各种不同类型和型号的近红外分析仪在市场上都有销售，但是分析仪器的价格相对较高，尤其是傅立叶变换型（如美国Nicolet 公司）、光栅扫描型（丹麦 Foss 公司）等高精度分析仪，普通商业用户难以承受，无法大面积推广。所以如何降低仪器研制成本并保持足够的分析精度是研究人员关心的主要问题之一。
滤光片型近红外光谱分析仪成本相对较低，而且定标模型的长期稳定性较好以及仪器的操作和维护很方便，但由于滤光片有限，难以应对复杂样品,该型仪器研制中定标模型的优选以及同型号仪器间定标模型的转移问题一直以来是近红外工作者讨论的热点。
近红外光谱分析仪器的定量分析精度除了与自身的信噪比及稳定性有关外，参考理化分析方法的精度也直接影响了定标模型所给出的测量结果精度，所以如何进一步提高理化参考分析方法的精度以提高仪器测得的近红外光谱吸光度数据与理化分析值的相关性需要等待理化学科的发展。
尽管化学计量学的发展成功地解释了定标模型波长通道信息与物质化学信息之间相关性，同时对定标数据的前处理提高了模型的稳定性和精度，但是与直接采用光谱数据 Log(1/R)所计算得到的结果相比较精度提高较小而且极大地增加了数据处理的复杂性，所以只有通过对物质与光作用机制的进一步研究和理解来从根本上解决物质成份光谱之间以及外界因素对定标模型的干扰问题。
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