(1)按研究微生物的基本生命活動規(guī)律為目的來分 總學(xué)科稱普通微生物學(xué)(General Microbiology),分科如微生物分類學(xué),微生物遺傳學(xué),微生物生理學(xué),微生物生態(tài)學(xué)和分子微生物學(xué)等。
(2)按微生物應(yīng)用領(lǐng)域來分 總科學(xué)稱應(yīng)用微生物學(xué)(Applied Microbiology),分科如工業(yè)微生物學(xué),農(nóng)業(yè)微生物學(xué),醫(yī)學(xué)微生物學(xué),藥用微生物學(xué),診斷微生物學(xué),抗生素學(xué)和食品微生物學(xué)等。
(3)按研究的微生物對象分 如細菌學(xué),真菌學(xué)(菌物學(xué)),病毒學(xué),原核生物學(xué),自養(yǎng)生物學(xué)和厭氧菌生物學(xué)等。
(4)按微生物所處的生態(tài)環(huán)境分 如土壤微生物學(xué),微生態(tài)學(xué),海洋微生物學(xué),環(huán)境微生物學(xué),水微生物學(xué)和宇宙微生物學(xué)等。
(5)按學(xué)科間交叉、融合分 如化學(xué)微生物學(xué),分析微生物學(xué),微生生物工程學(xué),微生物化學(xué)分類學(xué),微生物數(shù)值分類學(xué),微生物地球化學(xué)和微生物信息學(xué)等。
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