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FFPE样本是什么？
做病理的小伙伴对FFPE样本肯定不陌生，FFPE（Formalin-Fixed and Parrffin Embedded）样本是福尔马林固定石蜡包埋的样本，固定包埋的方法能够使组织在常温保存很长时间。早FFPE样本主要是用于病理形态学观察，近些年，随着精////准医疗的渗透发展，FFPE样本在临床病理检验、肿瘤基因检测中也得到广泛使用。
图1 FFPE样本
人们将FFPE样本中的核酸提取出来进行建库，然后利用高通量测序技术对FFPE样本的核酸进行测序和分析，就能得到病理和肿瘤相关的很多重要信息。加上FFPE样本方便保存的特点，不论在检验检测还是医学研究中都是一个好帮手。
FFPE样本建库的不完美
福尔马林固定石蜡包埋样本虽然使组织得以长期保存，但其特殊的制作方法和保存过程会对核酸分子造成多方面的影响：
- 福尔马林固定使核酸与蛋白发生交联，影响核酸提取质量；
- 石蜡高温渗入过程加速磷酸二脂键的水解，导致核酸降解；
- 福尔马林固定以及不理想的保存条件使胞嘧啶脱氨基引入C→T，G→A等突变；
- 固定和包埋增加核酸分子脆性，造成核酸高度片段化等。
这使得FFPE样本中的核酸质量往往很差，用FFPE样本建库测序就面临诸多挑战：
怎么办，拿FFPE样本没法子了么？
FFPE DNA修复试剂
Hieff NGS® FFPE DNA Repair Reagent是针对FFPE样本而设计的修复试剂，可修复低质量FFPE样本不同程度的损伤，提高文库产量及测序质量。具体来说，能修复胞嘧啶脱氨成尿嘧啶、切刻与缺口、碱基氧化、3’端封闭等损伤类型。
损伤类型 | 是否修复 |
胞嘧啶脱氨成尿嘧啶 | √ |
切刻与缺口 | √ |
碱基氧化 | √ |
3’端封闭 | √ |
DNA////片段化 | × |
核酸蛋白交联 | × |
FFPE DNA修复试剂可搭配市面上通用的建库产品，完成FFPE样本的损伤修复；配合翊圣生物Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit（Cat#12199，13310）建库试剂盒使用，只需要把修复试剂加到反应体系中就可以了，不需要额外的操作步骤，很方便呦。
DNA修复显著提高文库产量
图2是用翊圣UltimaTM DNA建库试剂盒（Cat#12199）建库，测试翊圣FFPE DNA Repair Reagent(Cat#12606)对建库产量的影响的数据。
图2 FFPE修复试剂盒对建库产量的影响（Input DNA: 10 ng; Cycles：10）
从测试结果看，Hieff NGS® FFPE DNA修复试剂显著提高了文库产量，尤其对于低质量的FFPE DNA样本，产量提升了3倍！
如果你正为低质量的FFPE样本DNA建库而苦恼，不如试试FFPE DNA修复试剂吧。FFPE样本建库，你需要的修复试剂在这里：Hieff NGS® FFPE DNA Repair Reagent (Cat#12606)
