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借助于噬菌体ELISA的DNA/RNA结合活性的分析方法

2012-12-15  阅读(1410)

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A.噬菌体的制备
1.挑取含有源自文库筛选的噬菌体克隆的单菌落。用灭菌牙签挑取单菌落接种于灭菌圆底培养板的微孔内,其中加有150ul含15ug/ml的四环素的2×TY培养基。用一个微孔培养展示野生型DNA/RNA结合区域的噬菌体,作为阳性对照。以250r/min的速度小心振荡微孔板,30℃培养16小时。
2.在合适的吊斗式离心机中3700g离心96孔培养板15分钟,以制备噬菌体上清液。将上清液转移到一个新的微孔板内,4℃保存。

B.噬菌体ELISA
1,将生物素联结的核酸靶标位点(通常是0~5pmol之间,稀释于50ul PBS缓冲液中)加入链亲和素包被的微孔板内。对于阳性对照,将适量的野生型结合位点加入一个微孔内。用一个只含PBS缓冲液的微孔作为阴性对照,以测定ELISA的本底。将微孔板于20℃放置15分钟。
2.每孔加入150gl含有4%(w/v)脱脂牛奶的PBS缓冲液作为封闭剂。将微孔板于20℃放置1小时。
3,将噬菌体上清液(得自步骤A2)1;10稀释于lml含有2%(w/v)脱脂牛奶、1%(体积分数)Tween-20及20ug/ml的超声破碎的鲑鱼精DNA的PBS缓冲液中。
4.将核酸包被的微孔中的封闭液弃去,加入50ul稀释过的噬茵体上清液。将微孔板于20℃放置l小时。
5.将结合液弃去,用200ul含1%(体积分数)Tween—20的PBS缓冲液洗涤7次,再用PBS缓冲液单独洗涤3次。
6.将HRP联结的抗M131gG抗体用含有2%(w/v)脱脂牛奶的PBS缓冲液作l:5000稀释,然后每孔加入50g1。20℃放置l小时。
7.将抗体结合液弃去,用200ul含0.05%(体积分数)Tween—20的PBS缓冲液洗涤3次,再用PBS缓冲液单独洗涤3次。
8.加入100ul HRP底物液,如上文所述的基于TMB的显色液,使ELISA显色。约5分钟后终止显色反应,如使用TMB,则加入100ul 1 mol/L的硫酸。立即用酶标仪测定ELISA数值。
9.要评估筛选出的结合区域的特异性序列的结合性,将它们的ELISA数值与阳性对照孔和阴性对照孔的数值进行比较。

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