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蛋白芯片技術(shù)的基本原理與技術(shù)的研究現(xiàn)狀

2012-12-6  閱讀(1589)

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          在多年的蛋白芯片技術(shù)的研究過(guò)程中,研究者為了尋找合適的物質(zhì)作為蛋白的載體進(jìn)行了不懈的探索。例如日本學(xué)者利用含有陽(yáng)離子表面活性劑(HTAB)脂質(zhì)體作為載體,通過(guò)戊二醛作用使其與一種鐵蛋白包裹外殼的成分結(jié)合組裝制備成一種納米水平的裝配體,這種裝配體可以在適當(dāng)?shù)膒H條件下使鐵蛋白分子進(jìn)入并固定于包裹外殼內(nèi)面,形成蛋白質(zhì)的載體。有人利用某些固體表面或覆蓋上含有電解質(zhì)的薄膜作為載體,可以將膠體蛋白質(zhì)顆粒成分轉(zhuǎn)移至薄膜上形成蛋白芯片。Uetz等在分析啤酒酵母基因組序列全長(zhǎng)度閱讀框架編碼各種蛋白質(zhì)的相互作用時(shí),使用不同孔數(shù)的平板作為載體,建立了約含有6 000個(gè)酵母轉(zhuǎn)化株組成的平板蛋白芯片系統(tǒng),平板上的每一個(gè)小孔中含有一個(gè)酵母轉(zhuǎn)化株,可以根據(jù)其活性功能區(qū)開(kāi)放閱讀框架的編碼表達(dá)生成一種蛋白質(zhì),這個(gè)系統(tǒng)可以用于蛋白質(zhì)功能的檢測(cè)和分析。Arenkov等利用聚丙烯酰胺凝膠板作為支持物,將蛋白樣品置于凝膠上,然后經(jīng)過(guò)電泳分離,使其成為蛋白的陣列用于進(jìn)一步的研究。zui近,哈佛大學(xué)蛋白芯片研究中心Gavin等利用制備DNA芯片的高精密度機(jī)械手的針狀點(diǎn)樣槍頭在只有顯微鏡載玻片一半大小的玻片上,制備了第1張含有樣品點(diǎn)數(shù)為10 800的蛋白芯片。這張芯片用已純化的蛋白G按每點(diǎn)為1納升的點(diǎn)樣量點(diǎn)樣10 799次,另一次用FRB(FK-BRl2—rapamycinbinding domain Of FKBP-rapamycin-associatedprotein)點(diǎn)樣。為了確保不同分子量的點(diǎn)樣蛋白質(zhì)都能夠被固定在玻片上,他們首先在玻片表面涂上BSA,然后使用N,N,—二琥珀酰胺碳酸(N,N’—disuccinimidyl carbonate)激活BSA表面的賴氨酸、天冬氨酸和谷氨酸殘基成為BSA-NHS玻片,其作用是促進(jìn)BSA與點(diǎn)樣蛋白質(zhì)的結(jié)合而使蛋白質(zhì)被固定于玻片上。在制備芯片過(guò)程中,為了保證被固定在載體上的蛋白質(zhì)依然保持天然的構(gòu)象和生物學(xué)活性,他們?cè)诘鞍踪|(zhì)點(diǎn)樣的磷酸鹽緩沖液中加入40%的甘油,以防止因水分的蒸發(fā)而造成蛋白質(zhì)變性。點(diǎn)樣后再經(jīng)3h的溫浴并將芯片浸泡于含有小牛血清蛋白(BSA)的緩沖液中,使芯片表面含有一層小牛血清蛋白,用于封閉與其他蛋白質(zhì)產(chǎn)生非特異性結(jié)合的部位及在表面未參加反應(yīng)的醛基。為了檢測(cè)芯片的應(yīng)用,他們用不同熒光抗體分別標(biāo)記能與蛋白G和FRB特異結(jié)合的IgG和FKBPl2(12Kd FK506—bindingprotein)并作用于蛋白芯片,觀察這些蛋白質(zhì)與蛋白芯片的相互作用,其結(jié)果清晰地顯示芯片上的蛋白G和單一的FRB點(diǎn)樣分別被標(biāo)上藍(lán)色和紅色熒光。該實(shí)驗(yàn)研究建立了蛋白質(zhì)樣品微量點(diǎn)樣技術(shù)并使蛋白質(zhì)固定于載體上時(shí)能夠保留原有的構(gòu)象和生物學(xué)活性,這為今后對(duì)蛋白質(zhì)多樣品的并行研究或快速分析——為制備高通量功能檢測(cè)的蛋白芯片奠定了技術(shù)基礎(chǔ)。

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