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基于ANSN的生成基质
的一般结构示出了基于6-氨基-1-萘磺酰胺(ANSN)荧光底物的一般结构。在本发明化合物家族中,R1是三肽,其COOH末端残基通常是精氨酸。R2和R3可以是氢,烷基,芳基或环烷基。虚线表示各种丝氨酸蛋白酶的水解位点。
含有荧光报告基团6-氨基-1-萘 - 磺酰胺(ANSN)的底物是用于监测各种丝氨酸蛋白酶(1-12)的酶活性的有用化合物。在这类化合物中,ANSN报告基团与短的三肽序列连接(在R1位置)。设计肽序列以优化酶和底物之间的相互作用??梢蕴砑拥絉2和R3位置的附加组分反映P'亚位点位置的变化,并且通常影响底物的动力学参数。作为有效底物的化合物在三肽和ANSN基团之间水解。一旦从肽部分切割,ANSN组的相对荧光增加约1000倍。
下页中确定的动力学特性将有助于选择合适的底物。已证明ANSN底物对因子VIIa(1-5,7,9,10,12)的分析特别有用。尽管单独的因子VIIa的底物水解速率相对较慢,但当将组织因子掺入测定系统时,几种化合物如化合物SN-17a在kcat中表现出大的变化。
使用信息:
基于ANSN的底物作为DMSO中的10mM储备溶液提供,并且通??捎糜诜治雠ǘ确段?00nM至低至50pM的酶。ANSN底物通常以50至100μM的终浓度使用,并且可以在大多数生理缓冲液(即TBS,HBS,PBS等)中稀释至该终浓度。可以使用标准荧光计或荧光板读数器监测反应(荧光的相对变化)。仪器设置在以下波长(激发= 352nm,发射= 470nm)时可以使用动力学或终点模式。通过在发射光束中采用390至450nm长通截止滤光器,可以小化光伪影。
每种底物的动力学性质列于下表中,并且在表格下方列出了期刊参考列表以供使用实例。
DMSO中的储备底物溶液应在4°C或更低温度下冷冻保存,并应避光保存。在这些条件下,化合物将保持稳定超过一年。
SN-5 6-氨基-1-萘磺酰胺基(ANSN)荧光底物定价:请咨询
安全数据表
结构体 | D-AFK-ANSNH-iC 4 H 9 .2HBr |
对...有用 | 对纤溶酶有用 |
公式 | DMSO |
浓度 | 10 mM |
动力学特性 | IIA | VIIa的 | Ⅶa因子/ TF | XA | XIa的 | aPC的 | tPA的 | 纤溶酶 |
K M | ND | ND | ND | ND | ND | ND | ND | 130 |
K 猫 | ND | ND | ND | ND | ND | ND | ND | 3.7 |
K cat / K M. | ND | ND | ND | ND | ND | ND | ND | 0.28 |
SN-7 6-氨基-1-萘磺酰胺基(ANSN)荧光底物
结构体 | Mes-D-LGR-ANSN(C 2 H 5)2 |
对...有用 | 对因子Xa有用 |
公式 | DMSO | |||||||||
浓度 | 10 mM | |||||||||
动力学特性 | IIA | VIIa的 | Ⅶa因子/ TF | XA | XIa的 | aPC的 | tPA的 | 纤溶酶 | ||
K M | 31 | 180 | 200 | 125 | 580 | 113 | ND | ND | ||
K 猫 | 0.63 | 0.007 | 0.79 | 36 | 15 | 0.055 | ND | ND | ||
K cat / K M. | 0.2 | ND | 0.04 | 2.9 | 0.26 | 0.005 | ND | ND |
SN-13a 6-氨基-1-萘磺酰胺基(ANSN)荧光底物
结构体 | D-LPR-ANSNH-C 3 H 7 • 2HCl |
对...有用 | 因子XIa有用 |
公式 | DMSO |
浓度 | 10 mM |
动力学特性 | IIA | VIIa的 | Ⅶa因子/ TF | XA | XIa的 | aPC的 | tPA的 | 纤溶酶 |
K M | 0.5 | 300 | 300 | 171 | 75 | 45 | 98 | ND |
K 猫 | 19 | 0.07 | 4.5 | 3.3 | 53 | 52 | 0.31 | ND |
K cat / K M. | 380 | 0.002 | 0.15 | 0.19 | 7.1 | 12 | 0.03 | ND |
SN-17a 6-氨基-1-萘磺酰胺基(ANSN)荧光底物
结构体 | D-FPR-ANSNH-C 6 H 11 • 2HCl |
对...有用 | 对凝血酶和VIIa有用 |
公式 | DMSO |
浓度 | 10 mM |
动力学特性 | IIA | VIIa的 | Ⅶa因子/ TF | XA | XIa的 | aPC的 | tPA的 | 纤溶酶 |
K M | 0.4 | 150 | 330 | 150 | ND | 7.8 | 36 | ND |
K 猫 | 17 | 0.05 | 8.4 | 0.32 | ND | 6.6 | 0.074 | ND |
K cat / K M. | 430 | 0.004 | 0.25 | 0.02 | ND | 8.6 | 0.02 | ND |
SN-17c 6-氨基-1-萘磺酰胺基(ANSN)荧光底物
结构体 | D-FPR-ANSNH-C 4 H 9 • 2HCl |
对...有用 | 对因子VIIa有用 |
公式 | DMSO |
浓度 | 10 mM |
动力学特性 | IIA | VIIa的 | Ⅶa因子/ TF | XA | XIa的 | aPC的 | tPA的 | 纤溶酶 |
K M | ND | 186 | 102 | ND | ND | 53 | ND | ND |
K 猫 | ND | 0.11 | 2.7 | ND | ND | 21 | ND | ND |
K cat / K M. | ND | 0.006 | 0.26 | ND | ND | 4 | ND | ND |
SN-18 6-氨基-1-萘磺酰胺基(ANSN)荧光底物
结构体 | Boc-L-(pF)FPR-ANSNH-C 2 H 5 |
对...有用 | 对tPA很有用 |
公式 | DMSO |
浓度 | 10 mM |
动力学特性 | IIA | VIIa的 | Ⅶa因子/ TF | XA | XIa的 | aPC的 | tPA的 | 纤溶酶 |
K M | 3.7 | 50 | 217 | ND | ND | ND | 71 | ND |
K 猫 | 44 | 0.008 | 0.88 | ND | ND | ND | 1.03 | ND |
K cat / K M. | 120 | 0.002 | 0.04 | ND | ND | ND | 0.15 | ND |
SN-20 6-氨基-1-萘磺酰胺基(ANSN)荧光底物
结构体 | Boc-L-FPR-ANSNH-C 2 H 5 |
对...有用 | 对凝血酶有用 |
公式 | DMSO |
浓度 | 10 mM |
动力学特性 | IIA | VIIa的 | Ⅶa因子/ TF | XA | XIa的 | aPC的 | tPA的 | 纤溶酶 |
K M | 17 | ND | ND | 100 | ND | 540 | 47 | ND |
K 猫 | 58 | ND | ND | 0.31 | ND | 2.2 | 0.011 | ND |
K cat / K M. | 34 | ND | ND | 0.003 | ND | 0.04 | 0.002 | ND |
SN-45 6-氨基-1-萘磺酰胺(ANSN)荧光底物
结构体 | L-EGR-ANSNH-C 3 H 7 •2 HBr |
对...有用 | 因子XIa有用 |
公式 | DMSO |
浓度 | 10 mM |
动力学特性 | IIA | VIIa的 | Ⅶa因子/ TF | XA | XIa的 | aPC的 | tPA的 | 纤溶酶 |
K M | 100 | ND | ND | 110 | 225 | 440 | ND | ND |
K 猫 | 2.5 | ND | ND | 0.2 | 82 | 17 | ND | ND |
K cat / K M. | 0.25 | ND | ND | 0.02 | 3.6 | 0.39 | ND | ND |
SN-54 6-氨基-1-萘磺酰胺基(ANSN)荧光底物
结构体 | BOC-D-VLR-ANSNH-C 4 H 9 |
对...有用 | 对aPC有用 |
公式 | DMSO |
浓度 | 10 mM |
动力学特性 | IIA | VIIa的 | Ⅶa因子/ TF | XA | XIa的 | aPC的 | tPA的 | 纤溶酶 |
K M | 19 | 42 | 170 | 19 | ND | 3.9 | ND | ND |
K 猫 | 0.055 | 0.007 | 1.6 | 0.055 | ND | 2.1 | ND | ND |
K cat / K M. | 0.03 | 0.002 | 0.09 | 0.03 | ND | 5.2 | ND | ND |
SN-59 6-氨基-1-萘磺酰胺基(ANSN)荧光底物
结构体 | D-VPR-ANSNH-C 4 H 9 • 2HCl |
对...有用 | 对凝血酶和aPC有用 |
公式 | DMSO |
浓度 | 10 mM |
动力学特性 | IIA | VIIa的 | Ⅶa因子/ TF | XA | XIa的 | aPC的 | tPA的 | 纤溶酶 |
K M | 2 | 89 | 52 | 160 | 520 | 54 | 110 | ND |
K 猫 | 110 | 0.019 | 0.76 | 3.3 | 92 | 72 | 0.71 | ND |
K cat / K M. | 550 | 0.002 | 0.14 | 0.21 | 1.8 | 13 | 0.065 | ND |
参考
出版物
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