亚洲精品综合日韩中文字幕网站_精品综合久久久久97_中文在线天堂网www_久久精品免费一区二区三区_91久久国产综合精品女同国语_久久资源总站在线国产成人

贝克曼库尔特国际贸易(上海)有限公司

贝克曼库尔特|NGS核酸纯化之洗脱篇:用啥洗?加多少?洗多久?加热吗?

时间:2022-5-9 阅读:1962
分享:

31.jpg

 

贝克曼库尔特基于SPRI技术的AMPure XPSPRIselect两种NGS文库纯化和片筛试剂。该技术采用顺磁性的磁珠、选择性的结合特定大小的核酸,被众多主流建库试剂盒及测序专家选用。

那么,金标准"还有优化的空间吗?让原厂来给您专业的分析:单从洗脱,有哪些优化的重点。

 

用什么洗?


32.jpg


如上图所示Tris or TE buffer (+/-EDTA)中,洗脱得率相比于纯水有了显著提升。而PBS溶液(pH 6-8)的效果紧随其后,且PH无显著影响。这可能与PBS中的盐离子的存在有关。另一方面,从稳定性(CV)上看,Tris\TE\PBS洗脱都优于水。

 

加多少?


33.jpg


如上图所示:对比了不同加样体积及洗脱体积的影响。所有的DNA起始浓度一致,因此洗脱体积越小,产物相对浓度越高(A);但是由于磁珠也会占用一部分洗脱溶液的体积(约1 µL),产物浓度越高则这部分损失越多(B);虽然小体积洗脱会得到影响核酸的得率,但是这并不是因为洗脱效率引起的:当投入量一致时,不同洗脱体积的得率无显著差异(C)

 

洗多久?加热吗?

34.jpg



如上图所示:在1分钟的时候,洗脱已经进入平台期(非指数期)提示大多数核酸已经洗脱下来。不加热的情况下,1分钟与20分钟洗脱相比,1分钟的量显著偏低(p < 0.01)。从2分钟洗脱开始,无显著差异。加热至60度后,洗脱速度更快:1分钟与其他时长无显著差异。

 

小结

 

上述实验通过使用lambda phage DNA (49 kb),对贝克曼库尔特的SPRI技术磁珠进行测试,提示:

 

  • 长达49 kb的核酸片段2分钟可以被充分洗脱。

  • 使用Tris溶液可以提升洗脱效率和稳定性。

  • 不同的起始及洗脱体积对洗脱效率影响不大。

  • 但是小体积的物理限制会导致更多核酸损失于死体积。

 


会员登录

×

请输入账号

请输入密码

=

请输验证码

收藏该商铺

X
该信息已收藏!
标签:
保存成功

(空格分隔,最多3个,单个标签最多10个字符)

常用:

提示

X
您的留言已提交成功!我们将在第一时间回复您~
拨打电话 产品分类
在线留言
南雄市| 西城区| 龙南县| 唐河县| 二手房| 盈江县| 长阳| 香格里拉县| 东宁县| 佛坪县| 石城县| 洪泽县| 隆化县| 福贡县| 临洮县| 甘谷县| 宾阳县| 禄劝| 新巴尔虎右旗| 西乌| 水富县| 建始县| 和龙市| 新乐市| 靖边县| 汉寿县| 沙坪坝区| 兴义市| 岳普湖县| 丰镇市| 淅川县| 深州市| 祁连县| 益阳市| 深圳市| 分宜县| 全州县| 大连市| 屏山县| 米易县| 淮阳县|