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人巨細胞病毒病毒基因組測序

時間:2013-6-24閱讀:1484
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 人巨細胞病毒是一種很常見的皰疹病毒,感染約50-100%的成人,但通常沒有不良影響,并且它可以保持潛伏多年。人巨細胞病毒感染是比較常見的,發(fā)展中國家感染人數(shù)比發(fā)達國家人數(shù)多。

該病毒可導(dǎo)致出新生兒生缺陷和免疫系統(tǒng)受損,可能會導(dǎo)致致命疾病。該病毒也與癌癥發(fā)展有關(guān)聯(lián)。這項新的研究分析了病毒的蛋白質(zhì)組,并描述了所有表達的蛋白質(zhì)。

研究人員認為,以往研究潛在編碼蛋白質(zhì)的基因組很大程度上是計算機模型上的,這是不完整的。二十多年來,16個病毒株人巨細胞病毒基因組已被測序。

這是一個特別大的病毒基因組中,約240,000個堿基對。該小組開始研究感染HCMV的人成纖維細胞的核糖體。核糖體是細胞內(nèi)制造蛋白質(zhì)的細胞器。他們用質(zhì)譜??分析以確定是否存在預(yù)測的蛋白質(zhì)。

研究發(fā)現(xiàn)了數(shù)以百計的蛋白質(zhì)編碼基因,這些基因此前未被確定在基因組中。編碼蛋白質(zhì)的DNApian段被稱為開放閱讀框架,在基因組序列的分析基礎(chǔ)上,以前的研究預(yù)測有200幀。

了解病毒基因組表達的蛋白質(zhì)可能有助于確定該病毒是如何影響宿主細胞的。相關(guān)研究論文發(fā)表在Science上,研究小組說核糖體分析技術(shù)和質(zhì)譜相結(jié)合方法可用于研究其他復(fù)雜病毒的蛋白質(zhì)組。

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