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基因組測(cè)序被簡(jiǎn)化
2013-2-20 閱讀(1055)
基因組測(cè)序被簡(jiǎn)化
近日，英國(guó)研究人員將基因組測(cè)序的標(biāo)準(zhǔn)流程簡(jiǎn)化，無(wú)需進(jìn)行文庫(kù)制備且只要很少量的DNA就能獲得序列數(shù)據(jù)，完成DNA（脫氧核糖核酸）單分子測(cè)序，用量可低至不到1納克（10億分之一克），僅為常規(guī)測(cè)序方法的500分之一到600分之一。
論文作者、英國(guó)威康信托基金會(huì)桑格研究所的保羅·庫(kù)普蘭說(shuō)：“我們用這種方法對(duì)病毒和細(xì)菌的基因組測(cè)序后發(fā)現(xiàn)，即使在相對(duì)較低的水平，我們也能夠確定所檢測(cè)的是何種有機(jī)物，不論樣本中是否存在特定的基因或質(zhì)粒，或者其他信息，如對(duì)特定DNA堿基的修改等。”
威康信托基金會(huì)桑格研究所的哈羅德·斯維爾德洛說(shuō)：“我們的技術(shù)可以在對(duì)所測(cè)序列沒(méi)有任何先驗(yàn)知識(shí)、沒(méi)有特定微生物試劑的條件下，在很短的時(shí)間內(nèi)操作，這是一種很有前途的替代手段，可應(yīng)用于控制感染等臨床需要。”
通過(guò)利用第三代單分子測(cè)序系統(tǒng)PacBio RS演示了這種簡(jiǎn)化的直接測(cè)序方法，事實(shí)證明，僅僅用800皮克（千分之一納克）DNA來(lái)分析一個(gè)生物體的基因組，盡管測(cè)序儀只讀取了基因組的70個(gè)序列片段，相對(duì)于常規(guī)測(cè)序方法獲得的數(shù)據(jù)來(lái)說(shuō)不過(guò)是很小的一部分，但這些信息足以讓研究人員確定生物體的品種。
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