雖然氣相色譜柱的種類很多，但分離效果主要取決于固定相，柱長(zhǎng)，柱內(nèi)徑和液膜厚度等因素。原則上，這幾個(gè)因素的分離效應(yīng)相同。只要這柱子的幾個(gè)因素相同。
因此，研究伙伴從列中選擇以下幾個(gè)方面：
1、柱長(zhǎng)的選擇分辨率與柱長(zhǎng)的平方根成正比。在其他條件相同的情況下，需要4倍的列長(zhǎng)度來獲得雙倍分辨率。
較短的色譜柱適用于較簡(jiǎn)單的樣品，特別是那些由結(jié)構(gòu)，極性和揮發(fā)性差異很大的組分組成的樣品。一般：15米短柱，用于快速分離更簡(jiǎn)單的樣品，也適用于掃描分析;30m色譜柱是常用的色譜柱長(zhǎng)度，大多數(shù)分析是在此長(zhǎng)度的色譜柱上完成的;50米，60米或更長(zhǎng)的長(zhǎng)柱用于分離更復(fù)雜的樣品。應(yīng)注意，柱長(zhǎng)的增加也增加了分析時(shí)間。

2、色譜柱內(nèi)徑的選擇色譜柱直徑直接影響色譜柱的效率，保留特性和樣品容量。小口徑柱比大口徑柱具有更高的效率，但柱容量更小。0.25mm：高柱效和低柱容量。要將復(fù)雜樣本分開。0.32mm：柱效率略低于0.25mm，但柱容量高出約60％。0.53mm：柱容量與填充柱相似。它可用于分流注射或不分流注射。當(dāng)柱容量是主要考慮因素（例如痕量分析）時(shí)，更適合選擇大直徑毛細(xì)管柱。
3、液膜厚度的選擇液膜的厚度影響柱的保持特性和柱容量。厚度增加并且保持力也增加。0.1~0.2m：液膜厚度薄的毛細(xì)管柱比厚液膜的毛細(xì)管柱快，所需柱溫低，高溫下柱損小，適合高分析沸點(diǎn)化合物。0.25~0.5m：普通液膜厚度。厚膜：有利于低沸點(diǎn)化合物的分析。
4、固定相的選擇不同固定不同分析物的不同效果，根據(jù)相似的相容性原理，性能越接近，相對(duì)于其固定的流動(dòng)阻力越大，其保留時(shí)間越長(zhǎng)。
該原理用于將不同性質(zhì)的混合物彼此分離。