亲水C18色谱柱在用于分离疏水性化合物与常规的C18相具有相似的选择性，所以也可以作为一种通用C18柱使用。亲水性色谱柱是专为亲水性和极性化合物具有更强的保留能力和选择性而设计的。典型的应用是对生物分子、代谢物和药物降解产物如有机酸、水溶性维生素、低聚糖、氨基酸以及小分子缩氨酸和小分子核苷等进行分离。
亲水C18色谱柱可以看成是正向色谱柱向水性流动相领域的延续，它的固定相与水的作用很强，适用于强极性物质的分析。而且它所采用的流动相以高的水溶性的有机相比例，与质谱相连时可以使目标物获取更高的离子化效率。
亲水性带有极性基团的分子，对水有大的亲和能力，可以吸引水分子，或溶解于水。这类分子形成的固体材料的表面，易被水所润湿。具有这种特性都是物质的亲水性。
亲水性指分子能够透过氢键和水形成短暂键结的物理性质。因为热力学上合适，这种分子不只可以溶解在水里，也可以溶解在其他的极性溶液内。
个亲水性分子，或说分子的亲水性部份，是指其有能力极化能形成氢键的部位，并使其对油或其他疏水性溶液而言，更容易溶解在水里面。亲水性和疏水性分子也可分别称为极性分子和非极性分子。
肥皂拥有亲水性和疏水性两端，以使其可以溶解在水里，也可以溶解在油里。因此，肥皂可以去除掉水和油之间的界面。
亲水C18材料对水具有亲合力的性能。金属板材如铬、铝、锌及其生成的氢氧化物以及具有毛细现象的物质都有良好的亲水效果。
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