活标本需要特殊的考虑，由于他们往往敏感荧光团，并不能防止受到抑制试剂此外漂白。此外，光学显微镜必要的低浓度的荧光标记通常会产生一个微弱的信号对比度差。另一个值得关注的是*暴露在激烈的低波长的光照往往限制了细胞和组织活力，显微镜因此实验的长度。一个好的解决方案可聘请高量子效率相机俗利用广角镜而不是光电倍增管，体视显微镜金相显微镜雪崩二极管探测器用于共聚焦和多光子的方法。在这种情况下反卷积技术可以提供zui满足的成像解决方案。另一个因素是可以限制的检测是一个受捐助者的化学计量学之间的范围之外。这一因素可能是一个严重的限制，生物显微镜在技术的蛋白质蛋白质相互作用，在其中北京金相显微镜一个合作伙伴可能是多余的浓度丈量。

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