056-05921 WAKO測序級天冬氨酰蛋白內(nèi)切酶Asp-N
- 公司名稱 石家莊西默科技有限公司
- 品牌 Wako/和光純藥
- 型號 056-05921
- 產(chǎn)地
- 廠商性質(zhì) 經(jīng)銷商
- 更新時間 2025/5/10 20:26:51
- 訪問次數(shù) 61
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| 供貨周期 | 兩周 | 貨號 | 056-05921 |
|---|---|---|---|
| 主要用途 | 高特異性、高蛋白質(zhì)消化率、適用于蛋白質(zhì)譜分析 |
WAKO測序級天冬氨酰蛋白內(nèi)切酶Asp-N
WAKO測序級天冬氨酰蛋白內(nèi)切酶Asp-N
人類蛋白質(zhì)組圖譜為超過90%的蛋白質(zhì)編碼基因提供了其蛋白質(zhì)翻譯證據(jù)，而由于選擇性剪接事件的存在，人類基因組約20,000個蛋白質(zhì)編碼基因中的蛋白質(zhì)組多樣性顯著增加。因此，精確檢測蛋白質(zhì)多樣性對于理解生物學功能至關(guān)重要。但由于目前蛋白質(zhì)組學技術(shù)的局限性，常用的蛋白質(zhì)組學檢測方法是通過部分肽段序列來確定整個蛋白質(zhì)的，其序列覆蓋率不足以表征樣本中存在的所有蛋白質(zhì)狀態(tài)。
◆實驗概況
研究人員使用6種不同的蛋白酶（Trypsin、LysC、LysN、GluC、AspN、Chymotrypsin，其中前5種蛋白酶FUJIFILM Wako均可提供）消化6種人類細胞系蛋白質(zhì)，碎片化后進行液相色譜分離和串聯(lián)質(zhì)譜分析。從17,717個蛋白質(zhì)編碼基因或蛋白質(zhì)組中識別100萬條特異性肽段，其序列覆蓋度中位數(shù)達到80%，大大提高了某法蛋白質(zhì)組學對單個蛋白的序列覆蓋率，為全面繪制蛋白質(zhì)多樣性圖譜奠定了基礎(chǔ)。
◆實驗結(jié)果
高蛋白質(zhì)組序列覆蓋度有助于更全面地檢測
不同可變檢測事件產(chǎn)生的蛋白isoform。依據(jù)RNA-Seq的數(shù)據(jù)，人體各器官和細胞系提供了超過95%的外顯子可變剪接的基因產(chǎn)物。但由于質(zhì)譜數(shù)據(jù)的覆蓋度不足，導致編碼出來的蛋白質(zhì)與可變剪接轉(zhuǎn)錄本的數(shù)量不成正比。
從下圖可以看到每種酶單獨使用時，都會產(chǎn)生明顯較低的檢測水平（圖1）。但是非某氨酸和非賴氨酸特異性的蛋白酶（GluC和AspN）與某蛋白酶聯(lián)合使用的時候，可以提高剪接位點的覆蓋度（圖2）。
產(chǎn)品編號 | 產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品規(guī)格 | 產(chǎn)品等級 |
125-05061 | Lysyl Endopeptidase Mass Spectrometry grade (Lys-C) 賴氨酰肽鏈內(nèi)切酶，質(zhì)譜級別 | 20 μg×5 | 蛋白研究用 |
056-05921 | Endoproteinase Asp-N, Sequencing grade 胞內(nèi)蛋白酶Asp-N（測序級別） | 2 μg | 生物化學用 |
050-05941 | Endoproteinaseglu C, Sequencing grade 胞內(nèi)蛋白Glu-C（測序級別） | 50 μg | |
164-13982 | V8 Protease [Endoproteinase Glu-C] V8蛋白酶 | 2 mg | |
207-08333 | Thermolysin 嗜熱菌蛋白酶 | 100 mg | |
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