实验介绍

4D-蛋白质组学是基于新一代timsTOF Pro质谱仪，通过捕集离子淌度（TIMS）与同步累积连续碎裂（PASEF）扫描模式进行差异定量蛋白质组学研究。该技术核心是在传统3D分离（保留时间、质荷比、离子强度）基础上，增加肽段的碰撞截面积（CCS），实现第4维度（离子淌度）的分离检测。 4D-DIA蛋白质组学是基于timsTOF Pro离子淌度平台的新一代DIA技术，通过数据非依赖采集-同步累积连续碎裂（diaPASEF）扫描模式进行差异定量蛋白质组学分析。将DIA技术与基于timsTOF Pro上的diaPASEF技术相结合，具有高扫描速度和高灵敏度优势的同时，外加第四维离子淌度分离，使DIA数据在采集时不牺牲窗口循环速度的同时，降低谱图复杂度和提高离子利用率，实现了蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。

实验流程：

应用方向

? 临床微量样本检测方式，如：外泌体、FFPE石蜡切片、活检穿刺组织等

? 临床大队列样本分析，如肿瘤、心血管等重大疾病精准分型

? 作物群体性状等大规模样本研究，如育种品系、胁迫干预等

? 临床生物标志物发现：DIA接近MRM的定量能力，实现标志物筛选与初步验证过程合二为一

? 生物样本信息库构建：DIA可实现生物信息的完整保存，为后续回溯分析提供保障。药物应答、基因敲除/过表达的蛋白表达谱分析

数据分析

技术优势

? 4D技术加持，更加适合微量样本

? 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制，灵活方便

? 采用布鲁克的timsTOF Pro质谱平台，检测速度提升近一倍