使用計量泵時，應定期檢查管線與閥的連接處是否有泄漏情況產生，而閥件應每3個月清潔一次，以免造成阻塞(清潔時間可依藥劑屬性來調整，如使用高結晶度的藥劑，至少每個月需清潔一次)。當計量泵長期沒有運作時，使用前也應進行清潔動作。
計量泵的清潔步驟：
(1)先施打清水約10分鐘，再空打約5分鐘后，確定管內的水都排出，才開始進行拆卸動作，以降低危險。
(2)關閉計量泵電源，拆下所有閥件(拆卸時，仍須小心殘余的藥劑及水份，避免造成傷害或濺到電源等相關設備而造成損害)。
(3)以清水沖洗閥及閥內零件。
(4)檢查零件是否有缺損、變形、龜裂等狀況，若有則進行更換。
(5)依原樣裝回所有閥件。
(6)施打清水5分鐘進行測試(若有結晶情況，可使用結晶稀釋劑施打約10分鐘，再換成清水施打約5分鐘)。
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